Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXV0

GFRAL, GDNF family receptor alpha-like, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRALQ6UXV0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GFRALQ6UXV0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GFRALQ6UXV0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GFRALQ6UXV0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GFRALQ6UXV0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GFRALQ6UXV0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GFRALQ6UXV0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GFRALQ6UXV0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GFRALQ6UXV0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GFRALQ6UXV0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GFRALQ6UXV0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GFRALQ6UXV0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GFRALQ6UXV0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GFRALQ6UXV0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GFRALQ6UXV0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GFRALQ6UXV0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GFRALQ6UXV0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GFRALQ6UXV0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GFRALQ6UXV0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GFRALQ6UXV0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GFRALQ6UXV0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GFRALQ6UXV0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GFRALQ6UXV0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GFRALQ6UXV0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GFRALQ6UXV0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GFRALQ6UXV0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GFRALQ6UXV0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GFRALQ6UXV0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GFRALQ6UXV0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GFRALQ6UXV0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GFRALQ6UXV0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFRALQ6UXV0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GFRALQ6UXV0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GFRALQ6UXV0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GFRALQ6UXV0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GFRALQ6UXV0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GFRALQ6UXV0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GFRALQ6UXV0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GFRALQ6UXV0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GFRALQ6UXV0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GFRALQ6UXV0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GFRALQ6UXV0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GFRALQ6UXV0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GFRALQ6UXV0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GFRALQ6UXV0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GFRALQ6UXV0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GFRALQ6UXV0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GFRALQ6UXV0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GFRALQ6UXV0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GFRALQ6UXV0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GFRALQ6UXV0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GFRALQ6UXV0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GFRALQ6UXV0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GFRALQ6UXV0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GFRALQ6UXV0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GFRALQ6UXV0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GFRALQ6UXV0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GFRALQ6UXV0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GFRALQ6UXV0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GFRALQ6UXV0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GFRALQ6UXV0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GFRALQ6UXV0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GFRALQ6UXV0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GFRALQ6UXV0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GFRALQ6UXV0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GFRALQ6UXV0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GFRALQ6UXV0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GFRALQ6UXV0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRALQ6UXV0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GFRALQ6UXV0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GFRALQ6UXV0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRALQ6UXV0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GFRALQ6UXV0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GFRALQ6UXV0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GFRALQ6UXV0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GFRALQ6UXV0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GFRALQ6UXV0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRALQ6UXV0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GFRALQ6UXV0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRALQ6UXV0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GFRALQ6UXV0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GFRALQ6UXV0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GFRALQ6UXV0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GFRALQ6UXV0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GFRALQ6UXV0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GFRALQ6UXV0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GFRALQ6UXV0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GFRALQ6UXV0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFRALQ6UXV0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRALQ6UXV0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFRALQ6UXV0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GFRALQ6UXV0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GFRALQ6UXV0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GFRALQ6UXV0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GFRALQ6UXV0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRALQ6UXV0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRALQ6UXV0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GFRALQ6UXV0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRALQ6UXV0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GFRALQ6UXV0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.9 ms