RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363350.1

RNU6-179P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 179, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-179P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-179P-201ENST00000363350 NCOR1O75376 2440 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 NCS1P62166 190 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 TAC4Q86UU9 113 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 HSPG2P98160 4391 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 MMGT1Q8N4V1 131 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-179P-201ENST00000363350 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 A0A0D9SFI3 127 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 PIRTP0C851 137 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 IGLC6P0CF74 106 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 UBE2D1P51668 147 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 B2MP61769 119 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 Q5VV11 94 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 PITX3O75364 302 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 SPRR2DP22532 72 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 WFDC2Q14508 124 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 RPRMQ9NS64 109 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 CREBBPQ92793 2442 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 LPAP08519 4548 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 OVOS2Q6IE36 1432 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 PIN1P1O15428 100 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 SCGB1A1P11684 91 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 SPTBN2O15020 2390 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF292O60281 2723 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 PTPN13Q12923 2485 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 M0R129 80 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 M0R3E3 92 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 TSPAN19P0C672 248 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 UBE2G1P62253 170 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 AKAP6Q13023 2319 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 ADGRB1O14514 1584 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 AIF1LQ9BQI0 150 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 KMT2AQ03164 3969 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 PARP14Q460N5 1801 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 DISP2A7MBM2 1401 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 IFNA17P01571 189 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 LINC00694P0DN24 101 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 Q5VSD8 79 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-179P-201ENST00000363350 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 A6NIN4 97 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 MT4P47944 62 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 Q6ZUT4 128 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 NCR2O95944 276 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRM1P04553 51 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 DAPK1P53355 1430 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 CBLN1P23435 193 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 CKS1BP61024 79 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 NF1P21359 2839 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 IL5P05113 134 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-179P-201ENST00000363350 PYDC1Q8WXC3 89 aa-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms