RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 H7C423 109 aa15.03■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 I3L3M4 83 aa15.03■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 USMG5Q96IX5 58 aa15.03■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.03■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 DMXL1Q9Y485 3027 aa15.03■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 ID1P41134 155 aa15.02■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.02■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 SPANXCQ9NY87 97 aa15.02■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF580Q9UK33 172 aa15.02■□□□□ -0
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa15.02□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa15.02□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 LRBAP50851 2863 aa15□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 H3BUA1 57 aa15□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3-11P01762 117 aa15□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 PRSS2P07478 247 aa15□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 SPXQ9BT56 116 aa15□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ACACAQ13085 2346 aa15□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 CCL21O00585 134 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 BRI3O95415 125 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 FOXC1Q12948 553 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 MIAQ16674 131 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ATMQ13315 3056 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 CD28P10747 220 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 CACNA1HO95180 2353 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 LST1O00453 97 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 CDSNQ15517 529 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 SMIM20Q8N5G0 67 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 CACNA1BQ00975 2339 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DCANP1Q8TF63 244 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 CLEC2BQ92478 149 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 PF4V1P10720 104 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 SPTBN2O15020 2390 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 LMO4P61968 165 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 HERV-K104P63124 156 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DUX3Q96PT4 197 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 AKAP13Q12802 2813 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 K7EMT4 169 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHG2P01859 326 aa14.9□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 CFAP161Q6P656 301 aa14.9□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.9□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM104AQ969W3 186 aa14.9□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.9□□□□□ -0.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.89□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TIMM17BO60830 172 aa14.89□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 NBL1P41271 181 aa14.89□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 NPC2P61916 151 aa14.89□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 Q6ZSV7 163 aa14.89□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM101Q96IK0 257 aa14.89□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 EDN2P20800 178 aa14.89□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.89□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.88□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.88□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 IGKV3-20P01619 116 aa14.87□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ACYP1P07311 99 aa14.87□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM126AQ9H061 195 aa14.87□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.87□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 K7ENP7 123 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 IMUPQ9GZP8 106 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A1W2PPR1 153 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC28Q96AY4 2481 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 LY6EQ16553 131 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 IGLV1-40P01703 118 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 A8MZ25 164 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MED13LQ71F56 2210 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CC-201ENST00000335007 LINC01587Q99440 93 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CC-201ENST00000335007 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.81□□□□□ -0.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa14.8□□□□□ -0.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa14.8□□□□□ -0.04
PPP1CC-201ENST00000335007 A6NDX4 124 aa14.8□□□□□ -0.04
PPP1CC-201ENST00000335007 H3BUX3 64 aa14.8□□□□□ -0.04
PPP1CC-201ENST00000335007 NDUFA1O15239 70 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms