RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 KIR2DL4Q99706 377 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa20.02■□□□□ 0.8
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SH3BP2-221ENST00000511747 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-221ENST00000511747 AMELXQ99217 191 aa20.02■□□□□ 0.8
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SH3BP2-221ENST00000511747 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-221ENST00000511747 CFAP126Q5VTH2 177 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-221ENST00000511747 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2D3P61077 147 aa20.01■□□□□ 0.79
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