RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 OR11H12B2RN74 326 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 SPINK4O60575 86 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 APCSP02743 223 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 S100A6P06703 90 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 CACNG7P62955 275 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ZFP82Q8N141 532 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 KNCNA6PVL3 124 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 HOXA5P20719 270 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 Q0VG73 95 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 KIR3DS1Q14943 382 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 UBE2CO00762 179 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 CAMPP49913 170 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZQT7 251 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 NTF3P20783 257 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ASIPP42127 132 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 RAB4BP61018 213 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 SLAQ13239 276 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 NXPH4O95158 308 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ESDP10768 282 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 NDUFA6P56556 154 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-217ENST00000583667 M0R2Z0 102 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 IGKV3-20P01619 116 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 TWIST1Q15672 202 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 ZNF124Q15973 351 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 STHQ8IWL8 128 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 PTH2Q96A98 100 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 TPPP3Q9BW30 176 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 J3KRW8 73 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 GNRH2O43555 120 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 CD7P09564 240 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 C9orf85Q96MD7 179 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 PPBPP02775 128 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 MUC21Q5SSG8 566 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 NAGKQ9UJ70 344 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 H3BVH4 76 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 INSP01308 110 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 SRIP30626 198 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 Q8N1Y9 231 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 SORL1Q92673 2214 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 RAB4AP20338 218 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 DEFB125Q8N687 156 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 RNF185Q96GF1 192 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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