RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 VPS29Q9UBQ0 182 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 FMN1Q68DA7 1419 aa-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADGRB1O14514 1584 aa-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SSNA1O43805 119 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR2H2O95918 312 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 KDELR2P33947 212 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 HIST1H3AP68431 136 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPATCH11Q8N954 259 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR5AK2Q8NH90 309 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCTD7Q96MP8 289 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR2H1Q9GZK4 316 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 FREM2Q5SZK8 3169 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF27Q86VH2 1401 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 MFSD11O43934 449 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCL2P10415 239 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 C9orf62Q8N4C0 152 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM216BQ8N7L0 139 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR5A2Q8NGI9 324 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR52A5Q9H2C5 316 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 V9GYV3 84 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 ROBO3Q96MS0 1386 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 PAPPAQ13219 1627 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 WNK3Q9BYP7 1800 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 H0YGG7 62 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAX1BP3O14907 124 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 RER1O15258 196 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL7P13232 177 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 UBE2G2P60604 165 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYL6P60660 151 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TNNC1P63316 161 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q5VV11 94 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SFXN4Q6P4A7 337 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 C4orf33Q8N1A6 199 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM86BQ8N661 226 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 CEP164Q9UPV0 1460 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 FGD6Q6ZV73 1430 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 EVPLLA8MZ36 301 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA8KD6RF30 607 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 F8VZ95 297 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 CST7O76096 145 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SERPINA1P01009 418 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SMIM17P0DL12 118 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SYT1P21579 422 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 AKR1D1P51857 326 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR10X1Q8NGY0 326 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR51I1Q9H343 314 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 NCAPD3P42695 1498 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM189A5PLL7 270 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFNA5P01569 189 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRACP01848 142 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 C8GP07360 202 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCL3L1P16619 93 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 DEFB123Q8N688 67 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRRC20Q8TCA0 184 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC35B4Q969S0 331 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 VPS25Q9BRG1 176 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SCN3BQ9NY72 215 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 MED11Q9P086 117 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 ABCC11Q96J66 1382 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAV5A0A0B4J249 113 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 A8MT66 165 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 H3BNG1 76 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCL2P13500 99 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 IMPG1Q17R60 797 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM151BQ6UXP7 276 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TEX29Q8N6K0 151 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 CT55Q8WUE5 264 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 PBDC1Q9BVG4 233 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRP6O75581 1613 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 PFDN6O15212 129 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 NDUFA6P56556 154 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q3ZCU0 254 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAB8BQ92930 207 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 MPC1Q9Y5U8 109 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 NSD3Q9BZ95 1437 aa-3.29□□□□□ -2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.2 ms