RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 CLEC3BP05452 202 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 NPFFO15130 113 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 LEPROTL1O95214 131 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-213ENST00000492657 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.96□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 JMJD8Q96S16 334 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CT45A10P0DMU9 189 aa9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 K7EMI3 77 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 PRR25Q96S07 402 aa9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 TMEM213A2RRL7 107 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 H3BUT2 72 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 USP24Q9UPU5 2620 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 TMEM189A5PLL7 270 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 OR5AL1P0C617 328 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-213ENST00000492657 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CCL19Q99731 98 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ST20Q9HBF5 79 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-69P01742 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.91□□□□□ -0.82
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