Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLEC3BP05452 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLEC3BP05452 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLEC3BP05452 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC3BP05452 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLEC3BP05452 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC3BP05452 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC3BP05452 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLEC3BP05452 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC3BP05452 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC3BP05452 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC3BP05452 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC3BP05452 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC3BP05452 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC3BP05452 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLEC3BP05452 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC3BP05452 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC3BP05452 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC3BP05452 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC3BP05452 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC3BP05452 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC3BP05452 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC3BP05452 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC3BP05452 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC3BP05452 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC3BP05452 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC3BP05452 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC3BP05452 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC3BP05452 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC3BP05452 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC3BP05452 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC3BP05452 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC3BP05452 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLEC3BP05452 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC3BP05452 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC3BP05452 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC3BP05452 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC3BP05452 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC3BP05452 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC3BP05452 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC3BP05452 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLEC3BP05452 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC3BP05452 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC3BP05452 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC3BP05452 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC3BP05452 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC3BP05452 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC3BP05452 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC3BP05452 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC3BP05452 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC3BP05452 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC3BP05452 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC3BP05452 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC3BP05452 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC3BP05452 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC3BP05452 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC3BP05452 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC3BP05452 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC3BP05452 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC3BP05452 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC3BP05452 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC3BP05452 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC3BP05452 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC3BP05452 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC3BP05452 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC3BP05452 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC3BP05452 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC3BP05452 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLEC3BP05452 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC3BP05452 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC3BP05452 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC3BP05452 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC3BP05452 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC3BP05452 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC3BP05452 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3BP05452 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3BP05452 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3BP05452 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLEC3BP05452 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC3BP05452 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3BP05452 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC3BP05452 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC3BP05452 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC3BP05452 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3BP05452 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC3BP05452 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3BP05452 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC3BP05452 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC3BP05452 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC3BP05452 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC3BP05452 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC3BP05452 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC3BP05452 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC3BP05452 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC3BP05452 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC3BP05452 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC3BP05452 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC3BP05452 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC3BP05452 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC3BP05452 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms