RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF714Q96N38 554 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C9orf170A2RU37 121 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LYRM1O43325 122 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IFNA7P01567 189 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TCRBP04435 133 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IMPG1Q17R60 797 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LIMD2Q9BT23 127 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LPAP08519 4548 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BCORL1Q5H9F3 1711 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EVI2AP22794 236 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ATP5G3P48201 142 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KLRD1Q13241 179 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM97Q5BJF2 176 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MALSU1Q96EH3 234 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC42Q96M95 316 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CST11Q9H112 138 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 POLQO75417 2590 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIK3C2GO75747 1445 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CETN3O15182 167 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IFNA4P05014 189 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IFITM1P13164 125 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AESQ08117 197 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF56Q15929 161 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PPTC7Q8NI37 304 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LINC00208Q96KT6 92 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ENY2Q9NPA8 101 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NAT8BQ9UHF3 227 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TGP01266 2768 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MIA2Q96PC5 1412 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIAS1O75925 651 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NFYBP25208 207 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SERPINB9P50453 376 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IFT20Q8IY31 132 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BTF3L4Q96K17 158 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTPRDP23468 1912 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COL24A1Q17RW2 1714 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FXYD1O00168 92 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RER1O15258 196 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GYPBP06028 91 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CRHP06850 196 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CEBPGP53567 150 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMBIM6P55061 237 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COTL1Q14019 142 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CFAP53Q96M91 514 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ACANP16112 2415 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MYLKQ15746 1914 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VWFP04275 2813 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IDO1P14902 403 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COX6A2Q02221 97 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPA17Q15506 151 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DDI1Q8WTU0 396 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AP1S3Q96PC3 154 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SIGMAR1Q99720 223 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HSPG2P98160 4391 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 F8P00451 2351 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ARPP19P56211 112 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NEDD8Q15843 81 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DSPPQ9NZW4 1301 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CEP164Q9UPV0 1460 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ITPR3Q14573 2671 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRAV5A0A0B4J249 113 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM114B3SHH9 223 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HIST1H2BKO60814 126 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ETV6P41212 452 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FXYD3Q14802 87 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HACD4Q5VWC8 232 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 Q5XG85 94 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-0.66□□□□□ -2.52
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