RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 NPBQ8NG41 125 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 FMC1Q96HJ9 113 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 EPDR1Q9UM22 224 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 HAX1O00165 279 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 NDUFA3O95167 84 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 FXYD5Q96DB9 178 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 PLXNB1O43157 2135 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 HES1Q14469 280 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 GATD1Q8NB37 220 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 NPIPB3Q92617 1050 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 AKAP6Q13023 2319 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 CHEK1O14757 476 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 P01737 135 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV3-48P01763 117 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2E1P51965 193 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 THAP8Q8NA92 274 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 CRYGCP07315 174 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 CSN1S1P47710 185 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GW15 77 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 LTAP01374 205 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 ATP5J2P56134 94 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 HSD52Q0P140 79 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-204ENST00000352260 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 SAP30O75446 220 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 CNIH1O95406 144 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 MORN5Q5VZ52 161 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 Q8N6K4 173 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 GTSF1Q8WW33 167 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 AJUBAQ96IF1 538 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 FGF6P10767 208 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 EBI3Q14213 229 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 PSMG4Q5JS54 123 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF747Q9BV97 191 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 PYYP10082 97 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 OR2K2Q8NGT1 345 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 SVIPQ8NHG7 77 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 PERPQ96FX8 193 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 RIPPLY3P57055 190 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 PSG3Q16557 428 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 C16orf54Q6UWD8 224 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 SAA4P35542 130 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 PATE2Q6UY27 113 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0G2JLM5 398 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 PAX8Q06710 450 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 MED13LQ71F56 2210 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 NPFFO15130 113 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 COX6B1P14854 86 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 NRGNQ92686 78 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 TACC2O95359 2948 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 RIGQ13278 110 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 TRGV9Q99603 122 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-204ENST00000352260 FBN2P35556 2912 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136 ms