RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDS3	YPR094W	MLH2	Q07980	695 aa		0.62	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	BSC6	Q08280	497 aa		0.62	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	VHS3	Q08438	674 aa		0.62	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.62	□□□□□ -2.31	not detected
RDS3	YPR094W	RSA1	Q08932	381 aa		0.62	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YPL216W	Q08964	1102 aa		0.62	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CAN1	P04817	590 aa		0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	REV1	P12689	985 aa		0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YND1	P40009	630 aa		0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CAF16	P43569	289 aa		0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	SAD1	P43589	448 aa		0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	NHX1	Q04121	633 aa		0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CDC9	P04819	755 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	IME1	P21190	360 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	MAK32	P23060	363 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	PET127	P32606	800 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	BRN1	P38170	754 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YIL092W	P40497	633 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CIN1	P40987	1014 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	BUD8	P41698	603 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	TIM54	P47045	478 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YJR039W	P47107	1121 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	MAL11	P53048	616 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	FCP1	Q03254	732 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	SVF1	Q05515	481 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YLR352W	Q06479	807 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	STP4	Q07351	490 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CYK3	Q07533	885 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	FLC1	Q08967	793 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	DCS2	Q12123	353 aa		0.6	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	BI2	P03873	423 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	HOP1	P20050	605 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YKU70	P32807	602 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	SCO2	P38072	301 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CDS1	P38221	457 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	0.59	□□□□□ -2.31	not detected
RDS3	YPR094W	KRE9	P39005	276 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	BEM4	P39011	633 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	GDH3	P39708	457 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YEL068C	P39977	110 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	FTR1	P40088	404 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	BET4	Q00618	327 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	FDC1	Q03034	503 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	YPS7	Q06325	596 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	PFA4	Q12006	378 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	TGS1	Q12052	315 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	TIP41	Q12199	356 aa		0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
RDS3	YPR094W	CIT2	P08679	460 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	CDC23	P16522	626 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
RDS3	YPR094W	HOG1	P32485	435 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	LOT5	P34234	306 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	MRPL4	P36517	319 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	CCL1	P37366	393 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	FTH1	P38310	465 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	YPT11	P48559	417 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	SHE10	P53075	577 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	USA1	Q03714	838 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	YLR407W	Q06070	228 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	ARR3	Q06598	404 aa		0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	PRE4	P30657	266 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	EHT1	P38295	451 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	RRT2	P38332	387 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	MNN1	P39106	762 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	PXA1	P41909	870 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	AIM14	P53109	570 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	YNL092W	P53934	400 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	VTC3	Q02725	835 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	SND1	Q04007	877 aa		0.57	□□□□□ -2.32
RDS3	YPR094W	ARA2	Q04212	335 aa		0.57	□□□□□ -2.32

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