RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SIL1	Q08199	421 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	TRE1	Q08919	783 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SVS1	Q12254	260 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ARP7	Q12406	477 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ECM3	Q99252	613 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	TRS33	Q99394	268 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RIP1	P08067	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PSO2	P30620	661 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	MET22	P32179	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	EXO1	P39875	702 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	ASG1	P40467	964 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	BST1	P43571	1029 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YJR079W	P47126	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	HFM1	P51979	1187 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	SNO2	P53823	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	TRM82	Q03774	444 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PMT7	Q06644	662 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PEX15	Q08215	383 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	ALR1	Q08269	859 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	VPS54	Q12071	889 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PER33	Q12144	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	TRA1	P38811	3744 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
YNL057W	YNL057W	RDS1	P25611	832 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CDC11	P32458	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PXA2	P34230	853 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	FET5	P43561	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CIS3	P47001	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	AIM23	P47015	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	MND1	P53102	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PPM1	Q04081	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YML096W	Q04489	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	MDM38	Q08179	573 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	APC5	Q08683	685 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	HMI1	Q12039	706 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CCP1	P00431	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	DAL82	P21705	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	SEC6	P32844	805 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YJL070C	P40361	888 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PRK1	P40494	810 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	ARO80	Q04052	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	TAF9	Q05027	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	BNA5	Q05979	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	JIP3	O13555	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
YNL057W	YNL057W	MOD5	P07884	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	OM45	P16547	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	EMC4	P53073	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	RSC1	P53236	928 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	DOS2	P54858	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
YNL057W	YNL057W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	VPS20	Q04272	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	AGE1	Q04412	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	DAL81	P21657	970 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	AEP2	P22136	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	DAL2	P25335	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CIN8	P27895	1000 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	MIC60	P36112	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	TAE1	P38340	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CNN1	P43618	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	STU2	P46675	888 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	RTT101	P47050	842 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	AMA1	P50082	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	COG7	P53195	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.7 ms