RNA–Protein interactions for RNA: YMR274C

RCE1, Transcript of Type II CAAX prenyl protease, yeast

Gene RCE1, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCE1	YMR274C	LOT5	P34234	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	OAF3	P36023	863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	FAT1	P38225	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	HFI1	Q12060	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	HOP1	P20050	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	VID28	P40547	921 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	YFL015C	P43578	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	ARR3	Q06598	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	BRN1	P38170	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	SNO3	P43544	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	RSC9	Q03124	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCE1	YMR274C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	CDC26	P14724	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	EUG1	P32474	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	MTC7	P32633	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	CCL1	P37366	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	YPT10	P38146	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	LRO1	P40345	661 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	BST1	P43571	1029 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	STB2	P46679	850 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	SAP4	P53036	818 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RCE1	YMR274C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	YDL183C	P48569	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	WAR1	Q03631	944 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	HMG2	P12684	1045 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	TSR4	P25040	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	DGR2	P32330	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	DID4	P36108	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	APM4	Q99186	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	OPT1	P40897	799 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	USA1	Q03714	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	BSP1	Q06604	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	VPS33	P20795	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	GSY2	P27472	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	YJL193W	P39542	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	UME1	Q03010	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	JHD1	P40034	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	MEP2	P41948	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	IRC8	P47046	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	PMT3	P47190	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	MNT3	P40549	630 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	TDA10	P42938	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RCE1	YMR274C	PCI8	P40512	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
RCE1	YMR274C	PCL8	Q08966	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	CRC1	Q12289	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	AAC1	P04710	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	SPC97	P38863	823 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	SAE2	P46946	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	NUP145	P49687	1317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	PCK1	P10963	549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	BET2	P20133	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	HXT4	P32467	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	ASK1	P35734	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	YIL092W	P40497	633 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	GPG1	P53130	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	TPO3	Q06451	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
RCE1	YMR274C	DSS4	P32601	143 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	HRD3	Q05787	833 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	BI2	P03873	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	SEC12	P11655	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	PEF1	P53238	335 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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