RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	SPC105	P53148	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MET14	Q02196	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	LCD1	Q04377	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	FUS2	Q05670	677 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	OSW2	Q12202	724 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ECM29	P38737	1868 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RPC53	P25441	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PCL2	P25693	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ATG14	P38270	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YHR202W	P38887	602 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	LAM5	P43560	674 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	BFA1	P47113	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YJR096W	P47137	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PIG1	Q06216	648 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ESC8	Q08119	714 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	GNT1	Q12096	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YVC1	Q12324	675 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PRC1	P00729	532 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	GAL1	P04385	528 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CKA2	P19454	339 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SFL1	P20134	766 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	MBR1	P23493	339 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RPN12	P32496	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	TMT1	P32643	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	COT1	P32798	439 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SPC29	P33419	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RGD1	P38339	666 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SIT1	P39980	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YFL052W	P43551	465 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	TAF1	P46677	1066 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SHE10	P53075	577 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	VID30	P53076	958 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	DIP5	P53388	608 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SEC5	P89102	971 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SSY1	Q03770	852 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RKM2	Q03942	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ENT2	Q05785	613 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	TRE1	Q08919	783 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
RRN9	YMR270C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ALG1	P16661	449 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ADK2	P26364	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YRO2	P38079	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	MRX3	P38172	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YJL045W	P47052	634 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YGR045C	P53229	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CBK1	P53894	756 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PGA2	P53903	129 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ECM7	Q06200	448 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PTC5	Q12511	572 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ADE8	P04161	214 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CDC6	P09119	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	GLN3	P18494	730 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	NIC96	P34077	839 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YEL1	P34225	687 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CKB2	P38930	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	MOB1	P40484	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RTT102	P53330	157 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PNG1	Q02890	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CUR1	Q06469	252 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	FOB1	O13329	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	AEP2	P22136	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	NFS1	P25374	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PTP2	P29461	750 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CSE2	P33308	149 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CCL1	P37366	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SIP3	P38717	1229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	TOK1	P40310	691 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	GYP8	P43570	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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