RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W MND1P53102 219 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W BRE5P53741 515 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SNZ2P53824 298 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W USA1Q03714 838 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PIG1Q06216 648 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YDR018CQ12185 396 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W RTP1Q12751 981 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W RAD10P06838 210 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W GCR1P07261 785 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SWI5P08153 709 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YML002WP0CF17 737 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W EST1P17214 699 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W TRX1P22217 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SAT4P25333 603 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W VBA3P25594 458 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W KIP2P28743 706 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W UTR2P32623 467 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W BCS1P32839 456 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W MRP4P32902 394 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W VBA5P36172 582 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YBR197CP38306 217 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ARG2P40360 574 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W HLJ1P48353 224 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data6.54□□□□□ -1.36not detected
LCB3YJL134W DOS2P54858 310 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YMR102CQ03177 834 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W VPS72Q03388 795 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PRM6Q04705 352 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YDR344CQ05510 147 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W AIM39Q08223 395 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YPR027CQ12079 277 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W EMP46Q12396 444 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PCD1Q12524 340 aa6.54□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SLY1P22213 666 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YCR051WP25631 222 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W MGT1P26188 188 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ISC10P32645 267 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W BUD2P33314 1104 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SWC5P38326 303 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SAW1P39735 261 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W AFG3P39925 761 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YER186CP40101 306 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W TMA108P40462 946 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ZIP2P53061 704 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W COG6P53959 839 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W THI7Q05998 598 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W MDM38Q08179 573 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SDH5Q08230 162 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W TRE1Q08919 783 aa6.53□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PHO4P07270 312 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W CHS1P08004 1131 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W PUT4P15380 627 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W CBF1P17106 351 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W MRPL25P23369 157 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W CDC10P25342 322 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W KAR4P25583 335 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W DUR3P33413 735 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W SRB2P34162 210 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W DUG2P38149 878 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W YIL054WP40524 105 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W MKT1P40850 830 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W ALT2P52892 507 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W ISU1Q03020 165 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W YMR027WQ04371 470 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W CDD1Q06549 142 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W MNL2Q12205 849 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W NCA2Q12374 616 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W AHC1Q12433 566 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W RRD2Q12461 358 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W CTF3Q12748 733 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W VPS5Q92331 675 aa6.52□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W YPR117WQ06116 2489 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W CMD1P06787 147 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W HEM15P16622 393 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W SRV2P17555 526 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W LRE1P25579 583 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W MEI4P29467 408 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W TPS2P31688 896 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W PEX2P32800 271 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W DRE2P36152 348 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W AGP2P38090 596 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W YAP1801P38856 637 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W ASG7P46993 209 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W RSM26P47141 266 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W CDC55Q00362 526 aa6.51□□□□□ -1.37
LCB3YJL134W MUK1Q02866 612 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.3 ms