RNA–Protein interactions for RNA: YGR161C-D

YGR161C-D, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeast

Gene YGR161C-D, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR161C-D	YGR161C-D	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	SNZ2	P53824	298 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	FAP1	P53971	965 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	YPL272C	Q08984	517 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	DNF2	Q12675	1612 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	STE4	P18851	423 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	ACP1	P32463	125 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	OAR1	P35731	278 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	BET3	P36149	193 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	GDS1	P41913	522 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	NUP85	P46673	744 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	AAD10	P47182	288 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	PEX31	P53203	462 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	MAL12	P53341	584 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	GTR1	Q00582	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	SEG1	Q04279	960 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	PIB1	Q06651	286 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
YGR161C-D	YGR161C-D	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	LDB17	Q12342	491 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	GPR1	Q12361	961 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
YGR161C-D	YGR161C-D	CDC6	P09119	513 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	RAD18	P10862	487 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	PDR1	P12383	1068 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	CTF13	P35203	478 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	MAL32	P38158	584 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	VPS70	P47161	811 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	MKC7	P53379	596 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	OPT2	Q06593	877 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	MSW1	P04803	379 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	COR1	P07256	457 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	SNT1	P25357	1226 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	LHS1	P36016	881 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	PIM1	P36775	1133 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	2.71	□□□□□ -1.97	not detected
YGR161C-D	YGR161C-D	ASG1	P40467	964 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	TY4A-J	P47023	414 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	FMS1	P50264	508 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	YML6	P51998	286 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	YNL108C	P53929	270 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	BOP2	Q06150	570 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	PGC1	Q08959	321 aa		2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
YGR161C-D	YGR161C-D	STE12	P13574	688 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	DBF4	P32325	704 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	MAD3	P47074	515 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	CTH1	P47976	325 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	YDL186W	P48568	277 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	MNT4	P53745	580 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	YNL140C	P53910	189 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	ORC4	P54791	529 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	CIA1	Q05583	330 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	YLR456W	Q06199	204 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	GMC2	Q06201	188 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	YPL191C	Q08930	360 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	HEM2	P05373	342 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	UTR4	P32626	227 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	STE5	P32917	917 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	SEC66	P33754	206 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	STE13	P33894	931 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	HEL1	P36113	551 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	MAL33	P38157	468 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	SUL1	P38359	859 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	PRE3	P38624	215 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	RET2	P43621	546 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	SWC4	P53201	476 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	MRPL13	Q02204	264 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	SMA1	Q02651	245 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	NUP53	Q03790	475 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	CDA2	Q06703	312 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	COX6	P00427	148 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	PRB1	P09232	635 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	TEC1	P18412	486 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	TAF14	P35189	244 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	KTR7	P40504	517 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YGR161C-D	YGR161C-D	YIR042C	P40586	236 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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