RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	MED7	Q08278	222 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	ICL2	Q12031	575 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TAH18	Q12181	623 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	YDL177C	Q12257	170 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TRM11	Q12463	433 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CDC16	P09798	840 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TUP1	P16649	713 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PGS1	P25578	521 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MAC1	P35192	417 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	BLI1	P35727	113 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CDS1	P38221	457 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	COS111	P38308	924 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PLB1	P39105	664 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	GET2	P40056	285 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	RIC1	P40395	1056 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YIL077C	P40508	320 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SPT20	P50875	604 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MTL1	P53214	551 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	VPS62	P53285	467 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MRPS35	P53292	345 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MRPL19	P53875	158 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ORC3	P54790	616 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	VPS64	Q03944	604 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SDH5	Q08230	162 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SKM1	Q12469	655 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PCD1	Q12524	340 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YLR302C	O13544	120 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PEX1	P24004	1043 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YPT7	P32939	208 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CTF13	P35203	478 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YKR073C	P36153	106 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	BCD1	P38772	366 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	POL31	P46957	487 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ZAP1	P47043	880 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YDL183C	P48569	320 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	COG1	P53079	417 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	BSC5	P53755	489 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MRPL22	P53881	309 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TIM50	Q02776	476 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TRS31	Q03337	283 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YLR287C	Q05881	355 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	BRE4	Q07660	1125 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CDC6	P09119	513 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MET8	P15807	274 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	KAR4	P25583	335 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	LIP5	P32875	414 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	NUP120	P35729	1037 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YEL025C	P39991	1188 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ICP55	P40051	511 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TMN3	P40071	706 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YJR061W	P40355	935 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SKP2	P42843	763 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	IDS2	P46958	469 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SGM1	P47166	707 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TEL2	P53038	688 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	IMA1	P53051	589 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TIM10	P87108	93 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	GCN5	Q03330	439 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YKU80	Q04437	629 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YLR224W	Q05947	369 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	DUS4	Q06063	367 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TFC6	Q06339	672 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YFT2	Q06676	274 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	HUA2	Q12134	243 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	NBP2	Q12163	236 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ZRT2	Q12436	422 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SEM1	O94742	89 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PET122	P10355	254 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CDC20	P26309	610 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SWC3	P31376	625 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	BCS1	P32839	456 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	FMO1	P38866	432 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	LYS9	P38999	446 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YJL193W	P39542	402 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	NUP60	P39705	539 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PIG2	P40187	538 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	BST1	P43571	1029 aa		2.93	□□□□□ -1.94

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