RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRX1	YBL064C	PEX1	P24004	1043 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	LIP5	P32875	414 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	IFA38	P38286	347 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
PRX1	YBL064C	FTR1	P40088	404 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	GSM1	P42950	618 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	SPT20	P50875	604 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	SAP4	P53036	818 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	ARA2	Q04212	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	AIM41	Q12032	185 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	TUP1	P16649	713 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	MRPL36	P36531	177 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	NPR3	P38742	1146 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	SFB3	P38810	929 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	ESL1	P40456	1118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	ERG5	P54781	538 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	TRM8	Q12009	286 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	ATG2	P53855	1592 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	KOG1	P38873	1557 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	OPI1	P21957	404 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	SAN1	P22470	610 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	SET3	P36124	751 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	UME6	P39001	836 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	VPS8	P39702	1274 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	YER010C	P40011	234 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	CAB2	P40506	365 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	YIR042C	P40586	236 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	BAP3	P41815	604 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	SRB7	P47822	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	IMA1	P53051	589 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	FDC1	Q03034	503 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	TAF2	P23255	1407 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
PRX1	YBL064C	BET2	P20133	325 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	EHT1	P38295	451 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	COS111	P38308	924 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	FMO1	P38866	432 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	NUP60	P39705	539 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	YIL077C	P40508	320 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	POL31	P46957	487 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	TRS31	Q03337	283 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	YFT2	Q06676	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	ENB1	Q08299	606 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	ENT1	Q12518	454 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRX1	YBL064C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	RAD16	P31244	790 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	PAH1	P32567	862 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	TFC3	P34111	1160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	YEL068C	P39977	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	VFA1	P40080	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	PIG2	P40187	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	AMA1	P50082	593 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	CBK1	P53894	756 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	MEH1	Q02205	184 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	TIM50	Q02776	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	VPS64	Q03944	604 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	ADY4	Q05955	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	SDH5	Q08230	162 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	LAS17	Q12446	633 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	FOB1	O13329	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	SOD2	P00447	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	SEC12	P11655	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	BIK1	P11709	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	DCG1	P32460	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	CBF2	P32504	956 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	BCS1	P32839	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	TMN3	P40071	706 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	BST1	P43571	1029 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	ECL1	P48235	211 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	MUP1	P50276	574 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	SNO4	Q04902	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRX1	YBL064C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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