RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 CTDSP1Q9GZU7 261 aa13.37□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 OR7C2O60412 319 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 ETFRF1Q6IPR1 90 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 OR5T1Q8NG75 326 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 DOK5Q9P104 306 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 CNIH1O95406 144 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 AKR1D1P51857 326 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 HES1Q14469 280 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 C16orf82Q7Z2V1 217 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 THAP8Q8NA92 274 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 OR1P1Q8NH06 330 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 MED13LQ71F56 2210 aa13.36□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 NBR2O15453 112 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 MOSP00540 346 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 LGALS4P56470 323 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 TAS2R45P59539 299 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 COL12A1Q99715 3063 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 WNK2Q9Y3S1 2297 aa13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 FLNCQ14315 2725 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 PSMB11A5LHX3 300 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 COX7A2P2O60397 106 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 CRYGCP07315 174 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 OR10J4P0C629 311 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 C22orf15Q8WYQ4 148 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 ZNF503Q96F45 646 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 OVOL3O00110 214 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 S100A6P06703 90 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 C8orf88P0DMB2 117 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 SELENOTP62341 195 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 MORN5Q5VZ52 161 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 OR4X1Q8NH49 305 aa13.34□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 CORTO00230 105 aa13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 FBLN7Q53RD9 439 aa13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 C1QL4Q86Z23 238 aa13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 NECAP1Q8NC96 275 aa13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 SIRPDQ9H106 197 aa13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 TNFRSF19Q9NS68 423 aa13.33□□□□□ -0.27
TOM1-216ENST00000492723 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 H7BYZ3 331 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 PAX2Q02962 417 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 LINC01551Q86U37 167 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 FAM210BQ96KR6 192 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 UHRF2Q96PU4 802 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 PFDN5Q99471 154 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 RNF2Q99496 336 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 DMRT1Q9Y5R6 373 aa13.33□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 LMO4P61968 165 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 ZNF98A6NK75 572 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 TOX4O94842 621 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 IGHV4-39P01824 125 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 BPIFB3P59826 476 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 TMEM116Q8NCL8 245 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 NPBQ8NG41 125 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 OR2T10Q8NGZ9 312 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 CACNA1BQ00975 2339 aa13.32□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 NDUFA3O95167 84 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 PATE2Q6UY27 113 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 OR5AU1Q8NGC0 362 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 GALR1P47211 349 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 MINOS1Q5TGZ0 78 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 ANAPC16Q96DE5 110 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 OR5B12Q96R08 314 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 WNT10AQ9GZT5 417 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.31□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 FXYD3Q14802 87 aa13.3□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 C5orf64Q2M2E5 130 aa13.3□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 OOSP1A8MZH6 123 aa13.3□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 ORM2P19652 201 aa13.3□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TOM1-216ENST00000492723 C11orf52Q96A22 123 aa13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms