RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C DOT6P40059 670 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TMN3P40071 706 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ELO3P40319 345 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ARG2P40360 574 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL161WP40449 235 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DJP1P40564 432 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YAP5P40574 245 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MND2P40577 368 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC1P40986 491 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG10P41338 398 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MMM1P41800 426 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GYP8P43570 497 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C IES1P43579 692 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C STU2P46675 888 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SUM1P46676 1062 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DLD2P46681 530 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GUF1P46943 645 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C BUD13P46947 266 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RTT101P47050 842 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RSM26P47141 266 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RFX1P48743 811 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NUP84P52891 726 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C STR3P53101 465 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YGL140CP53120 1219 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C FLC3P53121 802 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX31P53203 462 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DRN1P53255 507 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR111WP53265 400 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C UTP8P53276 713 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR003CP53394 754 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS75P53853 264 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL144CP53907 740 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SFB2P53953 876 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C FAP1P53971 965 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC55Q00362 526 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SLT2Q00772 484 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MET14Q02196 202 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TBF1Q02457 562 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C UME1Q03010 460 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MUB1Q03162 620 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PIR3Q03180 325 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR187CQ03236 431 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR206WQ03695 313 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG16Q03818 150 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C INP2Q03824 705 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YHM2Q04013 314 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ARO80Q04052 950 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ARA2Q04212 335 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GYL1Q04322 720 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LCD1Q04377 747 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TMN2Q04562 672 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C POB3Q04636 552 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR278CQ05612 105 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C THI7Q05998 598 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LCB5Q06147 687 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TDA5Q06417 326 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR148CQ06523 435 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL073WQ07454 984 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SPO75Q07798 868 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data0.74□□□□□ -2.29not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM39Q08223 395 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TRE2Q08693 809 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NDD1Q08887 554 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL216WQ08964 1102 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SRO7Q12038 1033 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PIN2Q12057 282 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PER33Q12144 273 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C REC8Q12188 680 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HRT3Q12347 344 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LPX1Q12405 387 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RMD5Q12508 421 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS5Q92331 675 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MEX67Q99257 599 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NHA1Q99271 985 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR338WQ99326 363 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C FRT1Q99332 602 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CSF1Q12150 2958 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR422WQ06409 1932 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C JIP3O13555 125 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR462WO13556 202 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ENO1P00924 437 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C INH1P01097 85 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HOP09932 586 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YML002WP0CF17 737 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C IMA3P0CW40 589 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C IMA4P0CW41 589 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C INO1P11986 533 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PMS1P14242 873 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HEM15P16622 393 aa0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.9 ms