RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	GNT1	Q12096	491 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	YER152C	P10356	443 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
PPQ1	YPL179W	MRC1	P25588	1096 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	YSC83	P32792	385 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SEG2	P34250	1132 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	EAF5	P39995	279 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	YAP7	Q08182	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	PIN2	Q12057	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MNN4	P36044	1178 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	LCB2	P40970	561 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RTT102	P53330	157 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	YNL146W	P53906	100 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	VPS16	Q03308	798 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	VPS72	Q03388	795 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MSC2	Q03455	724 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	IES4	Q08561	116 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	LAA1	P39526	2014 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SPS1	P08458	490 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	PCK1	P10963	549 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	OM45	P16547	393 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SEC65	P29478	273 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	AIM26	P32858	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TIM23	P32897	222 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	ATG19	P35193	415 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	UIP5	P36137	443 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	PXL1	P36166	706 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RTT107	P38850	1070 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TVP23	P38962	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TYW3	P53177	273 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SEC5	P89102	971 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
PPQ1	YPL179W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CUR1	Q06469	252 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CDA2	Q06703	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RTP1	Q12751	981 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	PHO8	P11491	566 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
PPQ1	YPL179W	RPC53	P25441	422 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CDC11	P32458	415 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	COT1	P32798	439 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	AIM21	P40563	679 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	ORC5	P50874	479 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	HFM1	P51979	1187 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MDR1	P53258	950 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SPO75	Q07798	868 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TAO3	P40468	2376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	COX4	P04037	155 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TMT1	P32643	299 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MIC60	P36112	540 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	UBP13	P38187	747 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SPT8	P38915	602 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	GEM1	P39722	662 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	AZR1	P50080	613 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	VTC3	Q02725	835 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MLH2	Q07980	695 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RSB1	Q08417	382 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MED1	Q12321	566 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SNA3	P14359	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	TUP1	P16649	713 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	PHO13	P19881	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	SPO11	P23179	398 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MSS51	P32335	436 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MCM7	P38132	845 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	VID24	P38263	362 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	CTM1	P38818	585 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPQ1	YPL179W	MAD1	P40957	749 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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