RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	TRM11	Q12463	433 aa		4.4	□□□□□ -1.7
YVC1	YOR087W	HMG2	P12684	1045 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	POL3	P15436	1097 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	KIN82	P25341	720 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PRE4	P30657	266 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	RKM3	P38222	552 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	RPP1	P38786	293 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	MEF2	P39677	819 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ICP55	P40051	511 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YNL195C	P40168	261 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	DUS4	Q06063	367 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CRD1	Q07560	283 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	MED1	Q12321	566 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CLB4	P24871	460 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	MTC7	P32633	139 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YKR073C	P36153	106 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	MRPL36	P36531	177 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	TOS1	P38288	455 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	NPR3	P38742	1146 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PSF2	P40359	213 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	SAP4	P53036	818 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	AAD4	Q07747	329 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	POM34	Q12445	299 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	URA3	P03962	267 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	TAH11	P47112	604 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	MDR1	P53258	950 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	GCN5	Q03330	439 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	TGL5	Q12043	749 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ECM3	Q99252	613 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	SEC15	P22224	910 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CTF13	P35203	478 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CTF18	P49956	741 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YAP6	Q03935	383 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	VID22	Q05934	901 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	AIM41	Q12032	185 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	UME6	P39001	836 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CTH1	P47976	325 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ARA2	Q04212	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	TFC6	Q06339	672 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	SDH5	Q08230	162 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PCK1	P10963	549 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ARG1	P22768	420 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YBR138C	P38277	524 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	VPS8	P39702	1274 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	IMA1	P53051	589 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PEX1	P24004	1043 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CDC20	P26309	610 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
YVC1	YOR087W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	GET2	P40056	285 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	GSM1	P42950	618 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	MRPL22	P53881	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	RIT1	P23796	513 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	KAR4	P25583	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	RAD16	P31244	790 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PAH1	P32567	862 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CDS1	P38221	457 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	IFA38	P38286	347 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	AXL2	P38928	823 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PLB1	P39105	664 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YER010C	P40011	234 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	CAB2	P40506	365 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ACS1	Q01574	713 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	THI22	Q06490	572 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ENT1	Q12518	454 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.34	□□□□□ -1.71	not detected
YVC1	YOR087W	BET2	P20133	325 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	SAN1	P22470	610 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YVC1	YOR087W	YDL183C	P48569	320 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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