RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	YGR266W	P53326	701 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RSB1	Q08417	382 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SLX4	Q12098	748 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SPO21	Q12411	609 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	MEC1	P38111	2368 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	VBA3	P25594	458 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SGE1	P33335	543 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	HSP78	P33416	811 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	VBA5	P36172	582 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ERV46	P39727	415 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PEX14	P53112	341 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PIR3	Q03180	325 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	HRD3	Q05787	833 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	GIS3	Q12418	502 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	CDC4	P07834	779 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	CDC15	P27636	974 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ECM13	P38195	257 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SAK1	P38990	1142 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SUM1	P46676	1062 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PFD1	P46988	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	IML2	P47031	731 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	NRM1	P53718	249 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	FAR11	P53917	953 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YFT2	Q06676	274 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	TLG2	Q08144	397 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	OPI10	Q08202	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	TCO89	Q08921	799 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	MED1	Q12321	566 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	COX3	P00420	269 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PBS2	P08018	668 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YJU3	P28321	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SER33	P40510	469 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	TOS3	P43637	560 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SUN4	P53616	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ERF2	Q06551	359 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	NDD1	Q08887	554 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	HFA1	P32874	2273 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SEC63	P14906	663 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	CDC42	P19073	191 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	TTI1	P36097	1038 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	TGL4	P36165	910 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	MAL33	P38157	468 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YHR078W	P38799	552 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	CPR7	P47103	393 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YNL144C	P53907	740 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	LCB4	Q12246	624 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SUL2	Q12325	893 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RKM5	Q12367	367 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	GAL4	P04386	881 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	STE4	P18851	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SEC15	P22224	910 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	BRF1	P29056	596 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	HIR1	P32479	840 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	MRPL40	P36534	297 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	YBR053C	P38235	358 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	DSN1	P40568	576 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ASG7	P46993	209 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SWS2	P53937	143 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	RPN4	Q03465	531 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	HED1	Q03937	162 aa		4.66	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 197.8 ms