RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CBP3	P21560	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YCR015C	P25616	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MRPL7	P36519	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	APN2	P38207	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	NEM1	P38757	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MGS1	P40151	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PCI8	P40512	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CTR1	P49573	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ALT2	P52892	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ALT1	P52893	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YNL034W	P53963	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YNL018C	P53976	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	HFD1	Q04458	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CDA2	Q06703	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TRE2	Q08693	809 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CLN3	P13365	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PLC1	P32383	869 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	HSP78	P33416	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ADD66	P36040	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SLX1	P38324	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	IES5	P40060	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	FMP10	P40098	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MPH1	P40562	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SLS1	P42900	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	GCV2	P49095	1034 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	COG4	Q06096	861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	NSI1	Q12457	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CDC9	P04819	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	WHI2	P12611	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MTC2	P34246	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ATG19	P35193	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	UBP11	P36026	717 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PET10	P36139	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	DRE2	P36152	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	STB5	P38699	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YHL017W	P38745	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YAP1801	P38856	637 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	EAF5	P39995	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ESL1	P40456	1118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	FIS1	P40515	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	VID28	P40547	921 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	OPT1	P40897	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	RTC4	P53850	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MUK1	Q02866	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	AIM33	Q04516	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TIP41	Q12199	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PCD1	Q12524	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SRD1	P09007	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MLS1	P30952	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	THI80	P35202	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	GAA1	P39012	614 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
RRN9	YMR270C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	HNT2	P49775	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YNR063W	P53749	607 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	UBX4	P54730	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	COQ9	Q05779	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YLH47	Q06493	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SDH5	Q08230	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	URK1	P27515	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	DPH2	P32461	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ALG3	P38179	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YHL026C	P38740	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PEX7	P39108	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	EPL1	P43572	832 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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