RNA–Protein interactions for RNA: YMR263W

SAP30, Transcript of Component of Rpd3L histone deacetylase complex, yeast

Gene SAP30, Length 606 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SAP30	YMR263W	HDA3	Q06623	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	TPK1	P06244	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	ERG11	P10614	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	SLA2	P33338	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	SIF2	P38262	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	APM2	P38700	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	TCD1	P38756	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	EFM4	P40516	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	MAF1	P41910	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	MND1	P53102	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YNL011C	P53980	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	EAR1	Q03212	550 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	ARO80	Q04052	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	SDH5	Q08230	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	TRE1	Q08919	783 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	HRT3	Q12347	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	EMP46	Q12396	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	STB3	Q12427	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	FRT1	Q99332	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	JIP3	O13555	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	BI2	P03873	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	BI4	P03879	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	CYT1	P07143	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	MAS1	P10507	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	PEX1	P24004	1043 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	GAC1	P28006	793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	MET4	P32389	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	HMT1	P38074	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YBR284W	P38150	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	TDA3	P38758	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	CAJ1	P39101	391 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	DSE1	P40077	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	PFD1	P46988	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	BRO1	P48582	844 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YGR021W	P53212	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YGR111W	P53265	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	JJJ1	P53863	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	HEH2	Q03281	663 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	VAC14	Q06708	880 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	MDM38	Q08179	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
SAP30	YMR263W	GPM2	Q12008	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	VPS54	Q12071	889 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	DAS2	Q12084	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	APM4	Q99186	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	PDE1	P22434	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	PGS1	P25578	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	TKL2	P33315	681 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	STU2	P46675	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	PUS2	P53167	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	SLG1	P54867	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	ADA2	Q02336	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	ESC2	Q06340	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	DDC1	Q08949	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	TAF10	Q12030	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAP30	YMR263W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	IDI1	P15496	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	RAD27	P26793	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	HXT1	P32465	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	SRB4	P32569	687 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	MRP4	P32902	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	SRB2	P34162	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	SEG2	P34250	1132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	BLI1	P35727	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	KDX1	P36005	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	RRT2	P38332	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	HIS2	P38635	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	RIM4	P38741	713 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	AVT2	P39981	480 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	TMN3	P40071	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	YER189W	P40104	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	PSY2	P40164	858 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	KHA1	P40309	873 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	ASG1	P40467	964 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	CDC1	P40986	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAP30	YMR263W	KAP114	P53067	1004 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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