RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	RAD9	P14737	1309 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SAC7	P17121	654 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	DAL7	P21826	554 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PRO1	P32264	428 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MAC1	P35192	417 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YKL151C	P36059	337 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	BYE1	P36106	594 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	UME6	P39001	836 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YEL068C	P39977	110 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SPO74	P45819	413 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CBK1	P53894	756 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	TFC6	Q06339	672 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	DIF1	O13577	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SWI6	P09959	803 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
RPS1B	YML063W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ATP12	P22135	325 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	NFS1	P25374	497 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SFA1	P32771	386 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YKR018C	P36114	725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ERT1	P38140	529 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	FAT1	P38225	669 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YBR225W	P38321	900 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YLF2	P38746	405 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	AXL2	P38928	823 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YER158C	P40095	573 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PUG1	P40100	303 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	KHA1	P40309	873 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	IRC5	P43610	853 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	INP52	P50942	1183 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	TAD1	P53065	400 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PHO5	P00635	467 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PMS1	P14242	873 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YHR202W	P38887	602 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MXR1	P40029	184 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YJL181W	P46987	611 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MAD3	P47074	515 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	EAR1	Q03212	550 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	VTI1	Q04338	217 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	TRI1	Q05024	226 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	OMS1	Q06668	471 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SLP1	Q12232	587 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	GCN4	P03069	281 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SIR1	P21691	654 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SGF29	P25554	259 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ERG3	P32353	365 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YHR218W	P38899	603 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	BEM4	P39011	633 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SWD1	P39706	426 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	NEO1	P40527	1151 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PRM2	P40534	656 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SFB2	P53953	876 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CIK1	Q01649	594 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	TLG1	Q03322	224 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	DCS2	Q12123	353 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ADH4	P10127	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS1B	YML063W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
RPS1B	YML063W	CLB4	P24871	460 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS1B	YML063W	PUP2	P32379	260 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS1B	YML063W	CNS1	P33313	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS1B	YML063W	OMA1	P36163	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS1B	YML063W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS1B	YML063W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS1B	YML063W	POP2	P39008	433 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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