RNA–Protein interactions for RNA: YML009C

MRPL39, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL39, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL39	YML009C	UME1	Q03010	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	REV1	P12689	985 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	IME2	P32581	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	RRN6	P32786	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PXL1	P36166	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	HSL7	P38274	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	TDA3	P38758	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	HEM14	P40012	539 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	UBP7	P40453	1071 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PRK1	P40494	810 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	MMM1	P41800	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SNZ3	P43545	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SNZ2	P53824	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PIR3	Q03180	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	AIM32	Q04689	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SIL1	Q08199	421 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	AIM39	Q08223	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
MRPL39	YML009C	CYC8	P14922	966 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PUT4	P15380	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	TUP1	P16649	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	KAR3	P17119	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PHO13	P19881	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YIH1	P25637	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	GUT1	P32190	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SEC6	P32844	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	RKM3	P38222	552 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PPX1	P38698	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	OSW5	P40219	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YAP5	P40574	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	BST1	P43571	1029 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	RMD8	P43620	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	RTT101	P47050	842 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	TAD1	P53065	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PUS2	P53167	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	VPS75	P53853	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ERV41	Q04651	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	OPY2	Q06810	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	AAD4	Q07747	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	CIR2	Q08822	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	HMI1	Q12039	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YRR1	Q12172	810 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	LCB4	Q12246	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	VPS5	Q92331	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	MSB2	P32334	1306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	BI2	P03873	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	BI4	P03879	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ROX1	P25042	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YKL050C	P35736	922 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	RTT107	P38850	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	LYS9	P38999	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	GDH3	P39708	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PEX31	P53203	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YGR111W	P53265	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	CWC24	P53769	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YNL144C	P53907	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	KTR6	P54070	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	DOS2	P54858	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	RKM2	Q03942	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	MSF1	P08425	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SPC110	P32380	944 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	STE13	P33894	931 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	GIP1	P38229	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	DUN1	P39009	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PRM9	P39551	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	VAC8	P39968	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YER189W	P40104	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	CNN1	P43618	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MRPL39	YML009C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	FLC3	P53121	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	SND1	Q04007	877 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	GYL1	Q04322	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	THI21	Q08975	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	ATG9	Q12142	997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL39	YML009C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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