RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	KIN3	P22209	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VPS3	P23643	1011 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PRR1	P28708	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PTR2	P32901	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	GRX7	P38068	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MTG2	P38860	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	IES5	P40060	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DAN4	P47179	1161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RIM21	P48565	533 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MIG2	P53035	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ZRG17	P53735	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YNL058C	P53947	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	URC2	Q04411	772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YAP7	Q08182	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	HMG2	P12684	1045 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
CLF1	YLR117C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
CLF1	YLR117C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RSM22	P36056	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YBR225W	P38321	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	APE4	P38821	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RGA1	P39083	1007 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YTA12	P40341	825 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YFL066C	P43538	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	IRC5	P43610	853 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RTS3	P53289	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ORC4	P54791	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	HER2	Q03557	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	FMN1	Q03778	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RSC3	Q06639	885 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RCN2	Q12044	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CDC6	P09119	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PEP12	P32854	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MRPL17	P36528	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ETR1	P38071	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YBR138C	P38277	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YHL008C	P38750	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YHR218W	P38899	603 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DDI1	P40087	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SET4	P42948	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SNZ3	P43545	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	IRC6	P43615	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YJL181W	P46987	611 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BIR1	P47134	954 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SNZ2	P53824	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ASI2	P53895	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YNL115C	P53925	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ORC3	P54790	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SED5	Q01590	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	GCN5	Q03330	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PSR2	Q07949	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	AIM41	Q12032	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MPH3	P0CE00	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RGR1	P19263	1082 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CLN2	P20438	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ATG19	P35193	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	LRG1	P35688	1017 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MIA40	P36046	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YHI9	P38765	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TRM5	P38793	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VMA7	P39111	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MBP1	P39678	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BRE2	P43132	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RIM8	P53179	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BSC5	P53755	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SLT2	Q00772	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CSC1	Q06538	782 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MLC2	Q06580	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MLH2	Q07980	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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