RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	PXA1	P41909	870 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	OSW7	P43611	510 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	NET1	P47035	1189 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	DNM1	P54861	757 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	ADR1	P07248	1323 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	CDS1	P38221	457 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	FTR1	P40088	404 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	RET2	P43621	546 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	BFA1	P47113	574 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	YIP4	P53093	235 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	SEC5	P89102	971 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	SWI6	P09959	803 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	PRE4	P30657	266 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	SFP1	P32432	683 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	MRPL7	P36519	292 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	FAT1	P38225	669 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	EHT1	P38295	451 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	CKB2	P38930	258 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	DUN1	P39009	513 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	SEC65	P29478	273 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	RIM4	P38741	713 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	HXT7	P39004	570 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	MNN1	P39106	762 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	YGR153W	P48238	217 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	MFM1	Q02783	413 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	RGT2	Q12300	763 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	CPR8	P53728	308 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	ECM9	Q02202	377 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	HLJ1	P48353	224 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	TAF4	P50105	388 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	SPO1	P53541	631 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	YHM2	Q04013	314 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	THI73	Q07904	523 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	YHR033W	P38690	423 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	PRM2	P40534	656 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	VID28	P40547	921 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	IES1	P43579	692 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	BUD17	P53727	317 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	ZPS1	Q12512	249 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YKL063C	YKL063C	CDC26	P14724	124 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	PMA2	P19657	947 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	OAF3	P36023	863 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	YNL018C	P53976	612 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	STP1	Q00947	519 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	FDC1	Q03034	503 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	GEP3	Q08622	556 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	CNE1	P27825	502 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	DAL3	P32459	195 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	MTC7	P32633	139 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	LTP1	P40347	161 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	YJL043W	P47053	257 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	YDL183C	P48569	320 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	ATP23	P53722	227 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	PIH1	P38768	344 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	THI6	P41835	540 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	SCS3	P53012	380 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	GPG1	P53130	126 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	MPS1	P54199	764 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	PPN1	Q04119	674 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
YKL063C	YKL063C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	YFL015C	P43578	164 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	YCG1	Q06680	1035 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	CIR2	Q08822	631 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	HFI1	Q12060	488 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	EXO1	P39875	702 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	COQ6	P53318	479 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	ATP12	P22135	325 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	MRPL9	P31334	269 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL063C	YKL063C	BEM3	P32873	1128 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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