RNA–Protein interactions for RNA: YGR239C

PEX21, Transcript of Peroxin required for peroxisomal matrix protein targeting, yeast

Gene PEX21, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX21	YGR239C	CDA2	Q06703	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	AIM41	Q12032	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	URA3	P03962	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	POL3	P15436	1097 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	TUP1	P16649	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ERP2	P39704	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	NUP60	P39705	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	SPC72	P39723	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ELO3	P40319	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	AMA1	P50082	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PEF1	P53238	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ENB1	Q08299	606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	SSP2	Q08646	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PCK1	P10963	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PEX1	P24004	1043 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CWH43	P25618	953 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PSY4	P38193	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	EHT1	P38295	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	COS111	P38308	924 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	SFB3	P38810	929 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
PEX21	YGR239C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	FTR1	P40088	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	SMK1	P41808	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	TAH11	P47112	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	THI22	Q06490	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	LAS17	Q12446	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	NUC1	P08466	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	SEC12	P11655	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PIG2	P40187	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PSF2	P40359	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	DIN7	Q12086	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	YLR358C	O13565	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CLB4	P24871	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	RNQ1	P25367	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	MTC7	P32633	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	BCS1	P32839	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	YBR053C	P38235	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	STB5	P38699	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PUG1	P40100	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	RFX1	P48743	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ACS1	Q01574	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CIA1	Q05583	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	COG4	Q06096	861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	YFT2	Q06676	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	IRC13	Q08630	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
PEX21	YGR239C	STE11	P23561	717 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	RIT1	P23796	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	YPT7	P32939	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	BCD1	P38772	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	REV7	P38927	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	TMN3	P40071	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	HOS4	P40480	1083 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ERG5	P54781	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ARA2	Q04212	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CHS3	P29465	1165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	MCM10	P32354	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	RPN12	P32496	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	SLC1	P33333	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	MRPL36	P36531	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CDS1	P38221	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	YLF2	P38746	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
PEX21	YGR239C	MNT3	P40549	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	YJL163C	P46996	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	TRI1	Q05024	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	TRM13	Q12383	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	CTT1	P06115	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEX21	YGR239C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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