RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W NUP60P39705 539 aa4.31□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W SAP185P40856 1058 aa4.31□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W SVS1Q12254 260 aa4.31□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YLR462WO13556 202 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W PCH2P38126 564 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YBR225WP38321 900 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W PCA1P38360 1216 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YHL049CP38722 271 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YEL075CP39972 122 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YER189WP40104 122 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W ASG1P40467 964 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W MND2P40577 368 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YFL064CP43540 174 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W CDC55Q00362 526 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W MSH6Q03834 1242 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W THI20Q08224 551 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YBL111CQ3E7Y5 667 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W SPE1P08432 466 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W MIS1P09440 975 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W TRX1P22217 103 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W NCL1P38205 684 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RRT2P38332 387 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W VAC8P39968 578 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W CEP3P40969 608 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W MNN11P46985 422 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YJL132WP47014 750 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W UTP8P53276 713 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W TOF2Q02208 771 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W GYL1Q04322 720 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W HRD3Q05787 833 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W AAD4Q07747 329 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W FLC1Q08967 793 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RRD2Q12461 358 aa4.3□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W APE1P14904 514 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W VMA4P22203 233 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W GCS1P35197 352 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W TMN3P40071 706 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YIL054WP40524 105 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W ECI1Q05871 280 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W MPC54Q08550 464 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W THI21Q08975 551 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W LCB4Q12246 624 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W GPM3Q12326 303 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W NDJ1Q12366 352 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W SPO21Q12411 609 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W ENO2P00925 437 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W GCG1P32656 232 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W NFU1P32860 256 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W LAM1P38851 1228 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YIR016WP40572 265 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W CDC1P40986 491 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RPC17P47076 161 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YJR079WP47126 109 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W CWC22P53333 577 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W VPS9P54787 451 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W BSP1Q06604 576 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W DDC1Q08949 612 aa4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W TAO3P40468 2376 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W PET123P17558 318 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W PAT1P25644 796 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W SGE1P33335 543 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W CCT4P39078 528 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W AVT2P39981 480 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RPT2P40327 437 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W SEC9P40357 651 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W MAF1P41910 395 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W TCB2P48231 1178 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RFX1P48743 811 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YMR187CQ03236 431 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W HER2Q03557 464 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W VTI1Q04338 217 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W TPO1Q07824 586 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YLR012CQ07927 99 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W CAP1P28495 268 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RRN6P32786 894 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W KAP104P38217 918 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W PRK1P40494 810 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W GYP8P43570 497 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W VTC4P47075 721 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RSM26P47141 266 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W UFO1Q04511 668 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YRR1Q12172 810 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W IZH4Q99393 312 aa4.28□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W PEX34P25584 144 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W GYP6P32806 458 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W ECM2P38241 364 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.6 ms