RNA–Protein interactions for RNA: YMR213W

CEF1, Transcript of Essential splicing factor, yeast

Gene CEF1, Length 1,773 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CEF1	YMR213W	MET12	P46151	657 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	MDV1	P47025	714 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YGL108C	P53139	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	USE1	P53146	245 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ABZ2	Q03266	374 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	RSC2	Q06488	889 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YDL114W	Q07530	308 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ATG29	Q12092	213 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	MNL2	Q12205	849 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	VCX1	Q99385	411 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	CDC6	P09119	513 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	FUS1	P11710	512 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.54	□□□□□ -1.36	not detected
CEF1	YMR213W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	SAS3	P34218	831 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	DCW1	P36091	449 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	PPS1	P38148	807 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YBR032W	P38223	100 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	SLI15	P38283	698 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YHL012W	P38709	493 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YHR112C	P38716	378 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	OCA5	P38738	679 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	SWD1	P39706	426 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	PAC11	P40960	533 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	RMR1	P53060	241 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	EEB1	Q02891	456 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YDR239C	Q03780	787 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	DYN3	Q04949	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	SPO75	Q07798	868 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	AVO1	Q08236	1176 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	PCL8	Q08966	492 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	AIM41	Q12032	185 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	AI4	P03878	556 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	RED1	P14291	827 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	OPI1	P21957	404 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	PLC1	P32383	869 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YKL063C	P35725	167 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	GRX7	P38068	203 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	APE4	P38821	490 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	SER33	P40510	469 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	SSN8	P47821	323 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ZIP2	P53061	704 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	TPO2	P53283	614 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	MDM1	Q01846	1127 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	TAF12	Q03761	539 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	GLO2	Q05584	274 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	NNT1	Q05874	261 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ARR2	Q06597	130 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YOL075C	Q08234	1294 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	NCR1	Q12200	1170 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	NTO1	Q12311	748 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	APM4	Q99186	491 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ERG11	P10614	530 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	HSF1	P10961	833 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	RPC53	P25441	422 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ACH1	P32316	526 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YHL008C	P38750	627 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	CCT6	P39079	546 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	SER3	P40054	469 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	KTR7	P40504	517 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	CST6	P40535	587 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	UBX4	P54730	416 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	ZDS2	P54786	942 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	MTC5	Q03897	1148 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	SMP3	Q04174	516 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	URC2	Q04411	772 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	TOS4	Q06266	489 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	MDM36	Q06820	579 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	YLR031W	Q07978	186 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEF1	YMR213W	MSM1	P22438	575 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	PEX1	P24004	1043 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	HIR1	P32479	840 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	SUV3	P32580	737 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	GLG1	P36143	616 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	YBR138C	P38277	524 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	AKR1	P39010	764 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	FTR1	P40088	404 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	ESL1	P40456	1118 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	RIM8	P53179	542 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEF1	YMR213W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37

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