RNA–Protein interactions for RNA: YMR130W

YMR130W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YMR130W, Length 909 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR130W	YMR130W	YKL222C	P35995	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YKL133C	P36066	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RIM4	P38741	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	HXT7	P39004	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SKY1	Q03656	742 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SGD1	Q06132	899 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	CDC6	P09119	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YCL002C	P25565	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ELM1	P32801	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	PTH2	P34222	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	LAM1	P38851	1228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	EMP65	P40085	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	MND2	P40577	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	DUS4	Q06063	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	PEX15	Q08215	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	HFI1	Q12060	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	MRP7	P12687	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RAD24	P32641	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	OAF3	P36023	863 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	MEF2	P39677	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ERP2	P39704	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SPO1	P53541	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ADY3	Q07732	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ALE1	Q08548	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	DIF1	O13577	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	HSF1	P10961	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SRP101	P32916	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YKR051W	P36142	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YHL041W	P38730	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YGR012W	P53206	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	HDA1	P53973	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	GCN5	Q03330	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	COG4	Q06096	861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	NKP2	Q06162	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	PSR2	Q07949	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	QCR6	P00127	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	KTR4	P38131	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	EXO84	P38261	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SLD3	P53135	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YBP2	P53169	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	VPS62	P53285	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YMR130W	YMR130W	ZDS2	P54786	942 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RMT2	Q03305	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ROT1	Q03691	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YHM2	Q04013	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	TPO1	Q07824	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	THI21	Q08975	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	DCS2	Q12123	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SWI1	P09547	1314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RAD50	P12753	1312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SOD2	P00447	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SPE1	P08432	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	MSS18	P08593	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	CDC16	P09798	840 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SWC3	P31376	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	STE13	P33894	931 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YKR018C	P36114	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SAP185	P40856	1058 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	SHR5	P41912	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	BNA2	P47125	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	NPY1	P53164	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR130W	YMR130W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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