RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	NTA1	P40354	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MMM1	P41800	426 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RGD2	P43556	714 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	FET5	P43561	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SGF73	P53165	657 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RTC4	P53850	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	FCP1	Q03254	732 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	INP2	Q03824	705 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YAP6	Q03935	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RRT8	Q08219	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	APE1	P14904	514 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	POL3	P15436	1097 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	AFR1	P33304	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	STN1	P38960	494 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MBP1	P39678	833 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SDS3	P40505	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YIR014W	P40570	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	CBK1	P53894	756 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TGL5	Q12043	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	JIP3	O13555	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ARG3	P05150	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ENA1	P13587	1091 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	STE11	P23561	717 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HMX1	P32339	317 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	NGG1	P32494	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SLA1	P32790	1244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
STB2	YMR053C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	UBP7	P40453	1071 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
STB2	YMR053C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	CAF16	P43569	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ALG2	P43636	503 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MET12	P46151	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TEL2	P53038	688 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YBP2	P53169	641 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YNR061C	P53747	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	EOS1	P53938	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	GTB1	Q04924	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ADE8	P04161	214 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	VPS3	P23643	1011 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DOA4	P32571	926 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DOM34	P33309	386 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
STB2	YMR053C	EFM2	P38347	419 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MRX1	P40050	688 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YJL171C	P46992	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ASK10	P48361	1146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SIW14	P53965	281 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	COB	P00163	385 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	STE6	P12866	1290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YEL043W	P32618	956 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PET10	P36139	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YBR284W	P38150	797 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SAP4	P53036	818 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	NCS6	P53088	359 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DON1	Q05610	365 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ATG33	Q06485	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PCD1	Q12524	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	INO1	P11986	533 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	GRR1	P24814	1151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	CWH43	P25618	953 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SLX1	P38324	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HXT7	P39004	570 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	THI6	P41835	540 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	JJJ1	P53863	590 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ARR1	Q06596	294 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 248.1 ms