RNA–Protein interactions for RNA: YJL178C

ATG27, Transcript of Type I membrane protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG27, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG27	YJL178C	DNF1	P32660	1571 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	SIR3	P06701	978 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	LYS9	P38999	446 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	NUP60	P39705	539 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	YEN1	P40028	759 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	YNL195C	P40168	261 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	YGR237C	P50089	785 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	MTL1	P53214	551 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	SSL2	Q00578	843 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	VTH1	P40438	1549 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	VTH2	P40890	1549 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	PAN1	P32521	1480 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	HIR1	P32479	840 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	APN2	P38207	520 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	TDA3	P38758	523 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	PCL5	P38794	229 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	FMO1	P38866	432 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	TSC11	P40061	1430 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	TSR4	P25040	408 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	GRX4	P32642	244 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	YHR202W	P38887	602 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	RET2	P43621	546 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	COX18	P53239	316 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
ATG27	YJL178C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG27	YJL178C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	PEX1	P24004	1043 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	MAL31	P38156	614 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	GET2	P40056	285 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YGR153W	P48238	217 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	ECM9	Q02202	377 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	SUT2	Q12286	268 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	ECM3	Q99252	613 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	SNT2	P53127	1403 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	HXT7	P39004	570 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	BEM4	P39011	633 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	HFD1	Q04458	532 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	SSM4	P40318	1319 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	NTE1	Q04958	1679 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	CDC43	P18898	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	DAL3	P32459	195 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YPT53	P36019	220 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YKR075C	P36155	307 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	SFB3	P38810	929 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	ARG2	P40360	574 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	FHN1	P53279	174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	VPS36	Q06696	566 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	NUP170	P38181	1502 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	UBS1	P38290	277 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
ATG27	YJL178C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	BFA1	P47113	574 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YPS7	Q06325	596 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	THI22	Q06490	572 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YBT1	P32386	1661 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	KIN3	P22209	435 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	PRP28	P23394	588 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	DMC1	P25453	334 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	SEC65	P29478	273 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YKU70	P32807	602 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	PHO11	P35842	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	FAT1	P38225	669 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	PHO12	P38693	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	NDC80	P40460	691 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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