RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	NSE3	Q05541	303 aa		5.53	□□□□□ -1.52
NEM1	YHR004C	POM34	Q12445	299 aa		5.53	□□□□□ -1.52
NEM1	YHR004C	HOT13	P36078	116 aa		5.52	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	RFX1	P48743	811 aa		5.52	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	MAL11	P53048	616 aa		5.52	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	DIP5	P53388	608 aa		5.52	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	ARP4	P80428	489 aa		5.52	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	STP1	Q00947	519 aa		5.52	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	UFO1	Q04511	668 aa		5.52	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	MIH1	P23748	554 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	YIL077C	P40508	320 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	IRC3	Q06683	689 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	MBR1	P23493	339 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	DSS1	P39112	969 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	COG8	Q04632	607 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	KIN82	P25341	720 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	YFT2	Q06676	274 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	ERR1	P0CX10	437 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	ERR2	P0CX11	437 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	COS111	P38308	924 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	ARG7	Q04728	441 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	VPS36	Q06696	566 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	SRD1	P09007	221 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	AAD3	P25612	363 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	MNN4	P36044	1178 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	YPL068C	Q02749	293 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	CIR2	Q08822	631 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NEM1	YHR004C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	YEL1	P34225	687 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	THI6	P41835	540 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	CPR8	P53728	308 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	YHR202W	P38887	602 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	YJR039W	P47107	1121 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	NNF1	P47149	201 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	YGL117W	P53133	265 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	TDA9	Q04545	1251 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	VHS3	Q08438	674 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	ELF1	P36053	145 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	SNF12	P53628	566 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	GEP3	Q08622	556 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	PET127	P32606	800 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	BIT61	P47041	543 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	IZH3	Q07959	543 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	RIM4	P38741	713 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	PIH1	P38768	344 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	EUG1	P32474	517 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	RGT1	P32862	1170 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	YKR075C	P36155	307 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	MEP2	P41948	499 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	PIP2	P52960	996 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	ATP23	P53722	227 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	ATG33	Q06485	197 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NEM1	YHR004C	MEF1	P25039	761 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	MRPL9	P31334	269 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	BEM3	P32873	1128 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	GIN4	Q12263	1142 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	STE4	P18851	423 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	YPT7	P32939	208 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	MAL31	P38156	614 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	UGO1	Q03327	502 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	TUP1	P16649	713 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	TSR4	P25040	408 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	TIM23	P32897	222 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	TRS23	Q03784	219 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	YLR125W	Q12138	136 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	ZPS1	Q12512	249 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	PMA2	P19657	947 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	PEX6	P33760	1030 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	AIM14	P53109	570 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	DCS2	Q12123	353 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	PCL2	P25693	308 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	APD1	P38281	316 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	NMD5	P46970	1048 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	BFA1	P47113	574 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	RPN4	Q03465	531 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	HMG1	P12683	1054 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	SNO3	P43544	222 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	IRC8	P47046	822 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
NEM1	YHR004C	YMR210W	Q03649	449 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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