RNA–Protein interactions for RNA: YHL002W

HSE1, Transcript of Subunit of the endosomal Vps27p-Hse1p complex, yeast

Gene HSE1, Length 1,359 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HSE1	YHL002W	FUB1	P25659	250 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	YPT7	P32939	208 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	SET3	P36124	751 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	GMH1	P36125	273 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	BIT61	P47041	543 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	YGR151C	P53287	111 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	COS111	P38308	924 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	MPS3	P47069	682 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	YGR153W	P48238	217 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	RFX1	P48743	811 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	UME1	Q03010	460 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	YML122C	Q03207	126 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	NTH1	P32356	751 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	EMP70	P32802	667 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	ATF1	P40353	525 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	PXA1	P41909	870 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	YFT2	Q06676	274 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
HSE1	YHL002W	NUP145	P49687	1317 aa		5.09	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	RPN13	O13563	156 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	SWI6	P09959	803 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	SPO11	P23179	398 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	KCC4	P25389	1037 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	CTP1	P38152	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	KHA1	P40309	873 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	SPC98	P53540	846 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	YPS7	Q06325	596 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	BNR1	P40450	1375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	SEC65	P29478	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	APL3	P38065	1025 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	YEL020C	P39994	560 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	ECM9	Q02202	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	HFD1	Q04458	532 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	ADY2	P25613	283 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	DUN1	P39009	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	NMA2	P53204	395 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	YHM2	Q04013	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	IME1	P21190	360 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	PEX2	P32800	271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	HXT7	P39004	570 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	BUD8	P41698	603 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	YGR237C	P50089	785 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	PPN1	Q04119	674 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	ARO10	Q06408	635 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	NDJ1	Q12366	352 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	DID4	P36108	232 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	STP4	Q07351	490 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	GPG1	P53130	126 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	DIP5	P53388	608 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	HFI1	Q12060	488 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	BRN1	P38170	754 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	SPO1	P53541	631 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	IZH3	Q07959	543 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	RKI1	Q12189	258 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HSE1	YHL002W	LAM4	P38800	1345 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	OAF3	P36023	863 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	FLO10	P36170	1169 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	YMC2	P38087	329 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	MUP3	P38734	546 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	TAF4	P50105	388 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	DOS2	P54858	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	PRE4	P30657	266 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	ELF1	P36053	145 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	FAT1	P38225	669 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	IES1	P43579	692 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	IMO32	P53219	342 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	NSE5	Q03718	556 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	UFO1	Q04511	668 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	APM4	Q99186	491 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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