RNA–Protein interactions for RNA: YBR187W

GDT1, Transcript of Protein of unknown function involved in calcium homeostasis, yeast

Gene GDT1, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GDT1	YBR187W	DMA2	P53924	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	HER2	Q03557	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	CYC8	P14922	966 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	GLN3	P18494	730 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	KIN3	P22209	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ATG19	P35193	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	PBY1	P38254	753 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	NPR3	P38742	1146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	KTR7	P40504	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YFL066C	P43538	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SPC98	P53540	846 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	RSM10	Q03201	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YFT2	Q06676	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	FMP45	Q07651	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SDH5	Q08230	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	HFI1	Q12060	488 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	APM4	Q99186	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	COQ1	P18900	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	UBP11	P36026	717 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	PIM1	P36775	1133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	TCD1	P38756	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	PES4	P39684	611 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	OSW5	P40219	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YNL165W	P53891	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SSL2	Q00578	843 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ELG1	Q12050	791 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ARP6	Q12509	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ATE1	P16639	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	RGP1	P16664	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	MLF3	P32047	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SCD5	P34758	872 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ISW1	P38144	1129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YBR284W	P38150	797 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SIF2	P38262	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	BFA1	P47113	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	RPN4	Q03465	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SEG1	Q04279	960 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	BSP1	Q06604	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	DSE3	Q08729	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	LCB4	Q12246	624 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	FRE7	Q12333	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	TRS33	Q99394	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	COX3	P00420	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	RDS1	P25611	832 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	TMT1	P32643	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YHL017W	P38745	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	BIR1	P47134	954 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	ARP5	P53946	755 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	KAR5	Q04746	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	BNA5	Q05979	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	HRT3	Q12347	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	COX4	P04037	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	VAN1	P23642	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	BEM1	P29366	551 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	RAD16	P31244	790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	LTV1	P34078	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	MET1	P36150	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YBR056W	P38081	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	CEP3	P40969	608 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	FET5	P43561	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	SFI1	Q12369	946 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GDT1	YBR187W	GPA1	P08539	472 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GDT1	YBR187W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GDT1	YBR187W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GDT1	YBR187W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GDT1	YBR187W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GDT1	YBR187W	SEF1	P34228	1148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GDT1	YBR187W	MAL33	P38157	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GDT1	YBR187W	RGD1	P38339	666 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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