RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mroh6	V9GX81	722 aa		32.63	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vmn2r23	E9PXI5	849 aa		32.62	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lyar	Q08288	388 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Usp28	Q5I043	1051 aa		32.62	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmem59l	Q7TNI2	337 aa		32.62	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	FAM186A	Q9D9R9	1790 aa		32.62	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rtkn2	Q14B46	604 aa		32.62	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fosb	P13346	338 aa		32.61	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ifit1	Q64282	463 aa		32.61	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snx13	Q6PHS6	957 aa		32.61	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mapk8ip1	Q9WVI9	707 aa		32.61	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp3a59	D3Z2W7	503 aa		32.6	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pla2g4f	Q50L41	855 aa		32.6	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nhsl1	Q8CAF4	1587 aa		32.6	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc112	A0AUP1	442 aa		32.59	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cfap99	A0A140LIX9	648 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Becn1	O88597	448 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Adcy5	P84309	1262 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snai1	Q02085	264 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc82	Q6PG04	518 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Alg3	Q8K2A8	438 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Terf2ip	Q91VL8	393 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zbtb43	Q9DAI4	467 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znfx1	Q8R151	1909 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp2c23	E9Q5K4	494 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tyro3	P55144	880 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zc3h12c	Q5DTV4	884 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tpcn2	Q8BWC0	731 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sept12	Q9D451	317 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trip6	Q9Z1Y4	480 aa		32.58	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmem109	Q3UBX0	243 aa		32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sf3b2	Q3UJB0	878 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ufl1	Q8CCJ3	793 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmem143	Q8VD26	458 aa		32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sh3bgr	Q9WUZ7	214 aa		32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	U2af1l4	Q8BGJ9	220 aa		32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdca8	Q8BHX3	289 aa		32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kcnq3	Q8K3F6	873 aa		32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tbc1d7	Q9D0K0	293 aa		32.57	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gabrd	P22933	449 aa		32.56	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Krt84	Q99M73	603 aa		32.56	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdc45	Q9Z1X9	566 aa		32.56	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Med23	Q80YQ2	1367 aa		32.56	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zkscan7	E9PVW1	718 aa		32.55	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Casp12	O08736	419 aa		32.55	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ezr	P26040	586 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Srek1	Q8BZX4	494 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gpr108	Q91WD0	569 aa		32.55	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Flii	Q9JJ28	1271 aa		32.55	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kif3a	P28741	701 aa		32.55	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mctp1	E9PV86	951 aa		32.54	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ube4a	E9Q735	1028 aa		32.54	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Npy5r	O70342	466 aa		32.54	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppfia3	P60469	1194 aa		32.54	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vezt	Q3ZK22	780 aa		32.54	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	C4b	P01029	1738 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Frmd7	A2AD83	703 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	1700029H14Rik	E9PY36	240 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cfap157	Q0VFX2	523 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Washc4	Q3UMB9	1173 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bsdc1	Q80Y55	427 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Col4a3bp	Q9EQG9	624 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bicdl1	A0JNT9	577 aa		32.52	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pank2	Q3U4S0	443 aa		32.52	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dpf1	Q9QX66	387 aa		32.52	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lipo1	J3QME6	396 aa		32.52	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bach2	P97303	839 aa		32.52	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Naa16	Q9DBB4	864 aa		32.52	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm20425	E9Q035	978 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Srprb	P47758	269 aa		32.51	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Smarcc1	P97496	1104 aa		32.51	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Acap3	Q6NXL5	833 aa		32.51	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mknk2	Q8CDB0	459 aa		32.51	■■■□□ 2.8
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hdlbp	Q8VDJ3	1268 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc47	Q9D024	483 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Napb	P28663	298 aa		32.5	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hvcn1	Q3U2S8	269 aa		32.5	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gimap8	Q75N62	688 aa		32.5	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rrp9	Q91WM3	475 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ube3c	Q80U95	1083 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lmod1	Q8BVA4	595 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nup98	Q6PFD9	1816 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gnat2	P50149	354 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mindy4	Q3UQI9	744 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pram1	Q6BCL1	675 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ggt6	Q6PDE7	497 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gpatch3	Q8BIY1	525 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sds	Q8VBT2	327 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cspp1	B2RX88	1205 aa		32.48	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pde6a	P27664	859 aa		32.48	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znf496	Q5SXI5	585 aa		32.48	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trh	Q62361	256 aa		32.48	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Metap2	O08663	478 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdkl5	Q3UTQ8	938 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rcan1	Q9JHG6	198 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Icoslg	Q9JHJ8	322 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mmel1	Q9JLI3	765 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myh2	G3UW82	1942 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rgs12	Q8CGE9	1381 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Crcp	O35427	148 aa		32.47	■■■□□ 2.79

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