Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2A8

Alg3, Dol-P-Man:Man(5)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,3-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg3Q8K2A8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
Alg3Q8K2A8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Alg3Q8K2A8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Alg3Q8K2A8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Alg3Q8K2A8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Alg3Q8K2A8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Alg3Q8K2A8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Alg3Q8K2A8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Alg3Q8K2A8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Alg3Q8K2A8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Alg3Q8K2A8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Alg3Q8K2A8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Alg3Q8K2A8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Alg3Q8K2A8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Alg3Q8K2A8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Alg3Q8K2A8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Alg3Q8K2A8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Alg3Q8K2A8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Alg3Q8K2A8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Alg3Q8K2A8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Alg3Q8K2A8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Alg3Q8K2A8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Alg3Q8K2A8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Alg3Q8K2A8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Alg3Q8K2A8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Alg3Q8K2A8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Alg3Q8K2A8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Alg3Q8K2A8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Alg3Q8K2A8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Alg3Q8K2A8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Alg3Q8K2A8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Alg3Q8K2A8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Alg3Q8K2A8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Alg3Q8K2A8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Alg3Q8K2A8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Alg3Q8K2A8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Alg3Q8K2A8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Alg3Q8K2A8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Alg3Q8K2A8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Alg3Q8K2A8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Alg3Q8K2A8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Alg3Q8K2A8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Alg3Q8K2A8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Alg3Q8K2A8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Alg3Q8K2A8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Alg3Q8K2A8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Alg3Q8K2A8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Alg3Q8K2A8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Alg3Q8K2A8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Alg3Q8K2A8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Alg3Q8K2A8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Alg3Q8K2A8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Alg3Q8K2A8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Alg3Q8K2A8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Alg3Q8K2A8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Alg3Q8K2A8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Alg3Q8K2A8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Alg3Q8K2A8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Alg3Q8K2A8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Alg3Q8K2A8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Alg3Q8K2A8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Alg3Q8K2A8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Alg3Q8K2A8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Alg3Q8K2A8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Alg3Q8K2A8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Alg3Q8K2A8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Alg3Q8K2A8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Alg3Q8K2A8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Alg3Q8K2A8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Alg3Q8K2A8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Alg3Q8K2A8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Alg3Q8K2A8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Alg3Q8K2A8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Alg3Q8K2A8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Alg3Q8K2A8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Alg3Q8K2A8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Alg3Q8K2A8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Alg3Q8K2A8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Alg3Q8K2A8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Alg3Q8K2A8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Alg3Q8K2A8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Alg3Q8K2A8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Alg3Q8K2A8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Alg3Q8K2A8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Alg3Q8K2A8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Alg3Q8K2A8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Alg3Q8K2A8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Alg3Q8K2A8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Alg3Q8K2A8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Alg3Q8K2A8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Alg3Q8K2A8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Alg3Q8K2A8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Alg3Q8K2A8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Alg3Q8K2A8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Alg3Q8K2A8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Alg3Q8K2A8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Alg3Q8K2A8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Alg3Q8K2A8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Alg3Q8K2A8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Alg3Q8K2A8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms