Protein–RNA interactions for Protein: A2AD83

Frmd7, FERM domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd7A2AD83 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
Frmd7A2AD83 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Frmd7A2AD83 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Frmd7A2AD83 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Frmd7A2AD83 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Frmd7A2AD83 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Frmd7A2AD83 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Frmd7A2AD83 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Frmd7A2AD83 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Frmd7A2AD83 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Frmd7A2AD83 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Frmd7A2AD83 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Frmd7A2AD83 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Frmd7A2AD83 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Frmd7A2AD83 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Frmd7A2AD83 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Frmd7A2AD83 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Frmd7A2AD83 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Frmd7A2AD83 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Frmd7A2AD83 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Frmd7A2AD83 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Frmd7A2AD83 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Frmd7A2AD83 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Frmd7A2AD83 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Frmd7A2AD83 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Frmd7A2AD83 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Frmd7A2AD83 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Frmd7A2AD83 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Frmd7A2AD83 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Frmd7A2AD83 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Frmd7A2AD83 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Frmd7A2AD83 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Frmd7A2AD83 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Frmd7A2AD83 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Frmd7A2AD83 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Frmd7A2AD83 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Frmd7A2AD83 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Frmd7A2AD83 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Frmd7A2AD83 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Frmd7A2AD83 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Frmd7A2AD83 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Frmd7A2AD83 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmd7A2AD83 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Frmd7A2AD83 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Frmd7A2AD83 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Frmd7A2AD83 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Frmd7A2AD83 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmd7A2AD83 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Frmd7A2AD83 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Frmd7A2AD83 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Frmd7A2AD83 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Frmd7A2AD83 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Frmd7A2AD83 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Frmd7A2AD83 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Frmd7A2AD83 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmd7A2AD83 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Frmd7A2AD83 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmd7A2AD83 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmd7A2AD83 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Frmd7A2AD83 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Frmd7A2AD83 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Frmd7A2AD83 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Frmd7A2AD83 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Frmd7A2AD83 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Frmd7A2AD83 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Frmd7A2AD83 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Frmd7A2AD83 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Frmd7A2AD83 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Frmd7A2AD83 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmd7A2AD83 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Frmd7A2AD83 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Frmd7A2AD83 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Frmd7A2AD83 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Frmd7A2AD83 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Frmd7A2AD83 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Frmd7A2AD83 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Frmd7A2AD83 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Frmd7A2AD83 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Frmd7A2AD83 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Frmd7A2AD83 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Frmd7A2AD83 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Frmd7A2AD83 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Frmd7A2AD83 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmd7A2AD83 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Frmd7A2AD83 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Frmd7A2AD83 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmd7A2AD83 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmd7A2AD83 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmd7A2AD83 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Frmd7A2AD83 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Frmd7A2AD83 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmd7A2AD83 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmd7A2AD83 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Frmd7A2AD83 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Frmd7A2AD83 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Frmd7A2AD83 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Frmd7A2AD83 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Frmd7A2AD83 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Frmd7A2AD83 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmd7A2AD83 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms