Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Ppfia3P60469 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ppfia3P60469 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ppfia3P60469 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ppfia3P60469 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ppfia3P60469 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ppfia3P60469 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Ppfia3P60469 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Ppfia3P60469 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ppfia3P60469 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Ppfia3P60469 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Ppfia3P60469 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ppfia3P60469 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ppfia3P60469 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Ppfia3P60469 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ppfia3P60469 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ppfia3P60469 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Ppfia3P60469 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ppfia3P60469 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ppfia3P60469 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ppfia3P60469 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ppfia3P60469 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ppfia3P60469 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ppfia3P60469 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ppfia3P60469 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ppfia3P60469 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ppfia3P60469 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ppfia3P60469 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ppfia3P60469 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ppfia3P60469 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Ppfia3P60469 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ppfia3P60469 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ppfia3P60469 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ppfia3P60469 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ppfia3P60469 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Ppfia3P60469 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ppfia3P60469 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ppfia3P60469 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ppfia3P60469 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppfia3P60469 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ppfia3P60469 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ppfia3P60469 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ppfia3P60469 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ppfia3P60469 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ppfia3P60469 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ppfia3P60469 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ppfia3P60469 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ppfia3P60469 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ppfia3P60469 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ppfia3P60469 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ppfia3P60469 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ppfia3P60469 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ppfia3P60469 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ppfia3P60469 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ppfia3P60469 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Ppfia3P60469 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ppfia3P60469 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ppfia3P60469 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ppfia3P60469 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ppfia3P60469 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ppfia3P60469 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ppfia3P60469 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ppfia3P60469 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ppfia3P60469 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ppfia3P60469 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ppfia3P60469 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ppfia3P60469 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ppfia3P60469 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ppfia3P60469 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ppfia3P60469 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ppfia3P60469 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ppfia3P60469 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ppfia3P60469 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ppfia3P60469 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ppfia3P60469 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ppfia3P60469 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ppfia3P60469 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ppfia3P60469 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ppfia3P60469 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ppfia3P60469 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ppfia3P60469 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ppfia3P60469 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ppfia3P60469 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ppfia3P60469 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ppfia3P60469 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ppfia3P60469 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ppfia3P60469 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ppfia3P60469 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ppfia3P60469 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ppfia3P60469 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ppfia3P60469 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ppfia3P60469 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ppfia3P60469 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppfia3P60469 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ppfia3P60469 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppfia3P60469 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ppfia3P60469 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ppfia3P60469 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ppfia3P60469 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ppfia3P60469 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms