Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
Casp12O08736 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Casp12O08736 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Casp12O08736 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Casp12O08736 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Casp12O08736 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Casp12O08736 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Casp12O08736 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Casp12O08736 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Casp12O08736 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Casp12O08736 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Casp12O08736 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Casp12O08736 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Casp12O08736 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Casp12O08736 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Casp12O08736 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Casp12O08736 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Casp12O08736 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Casp12O08736 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Casp12O08736 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Casp12O08736 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Casp12O08736 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Casp12O08736 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Casp12O08736 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Casp12O08736 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Casp12O08736 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Casp12O08736 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Casp12O08736 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Casp12O08736 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Casp12O08736 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Casp12O08736 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Casp12O08736 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Casp12O08736 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Casp12O08736 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Casp12O08736 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Casp12O08736 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Casp12O08736 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Casp12O08736 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Casp12O08736 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Casp12O08736 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Casp12O08736 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Casp12O08736 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Casp12O08736 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Casp12O08736 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Casp12O08736 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Casp12O08736 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Casp12O08736 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Casp12O08736 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Casp12O08736 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Casp12O08736 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Casp12O08736 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Casp12O08736 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Casp12O08736 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Casp12O08736 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Casp12O08736 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Casp12O08736 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Casp12O08736 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Casp12O08736 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Casp12O08736 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Casp12O08736 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Casp12O08736 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Casp12O08736 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Casp12O08736 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Casp12O08736 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Casp12O08736 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Casp12O08736 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Casp12O08736 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Casp12O08736 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Casp12O08736 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Casp12O08736 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Casp12O08736 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Casp12O08736 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Casp12O08736 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Casp12O08736 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Casp12O08736 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Casp12O08736 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Casp12O08736 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Casp12O08736 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Casp12O08736 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Casp12O08736 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Casp12O08736 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Casp12O08736 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Casp12O08736 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Casp12O08736 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Casp12O08736 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Casp12O08736 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Casp12O08736 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Casp12O08736 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Casp12O08736 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Casp12O08736 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Casp12O08736 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Casp12O08736 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Casp12O08736 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Casp12O08736 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Casp12O08736 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Casp12O08736 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Casp12O08736 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Casp12O08736 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Casp12O08736 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Casp12O08736 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms