Protein–RNA interactions for Protein: E9PV86

Mctp1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mctp1E9PV86 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
Mctp1E9PV86 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Mctp1E9PV86 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Mctp1E9PV86 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Mctp1E9PV86 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
Mctp1E9PV86 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Mctp1E9PV86 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Mctp1E9PV86 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Mctp1E9PV86 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Mctp1E9PV86 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Mctp1E9PV86 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Mctp1E9PV86 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Mctp1E9PV86 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Mctp1E9PV86 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Mctp1E9PV86 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Mctp1E9PV86 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Mctp1E9PV86 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Mctp1E9PV86 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Mctp1E9PV86 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Mctp1E9PV86 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Mctp1E9PV86 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Mctp1E9PV86 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Mctp1E9PV86 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Mctp1E9PV86 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Mctp1E9PV86 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Mctp1E9PV86 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Mctp1E9PV86 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Mctp1E9PV86 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Mctp1E9PV86 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Mctp1E9PV86 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Mctp1E9PV86 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Mctp1E9PV86 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Mctp1E9PV86 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Mctp1E9PV86 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Mctp1E9PV86 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Mctp1E9PV86 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Mctp1E9PV86 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Mctp1E9PV86 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Mctp1E9PV86 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Mctp1E9PV86 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Mctp1E9PV86 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mctp1E9PV86 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Mctp1E9PV86 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Mctp1E9PV86 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Mctp1E9PV86 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Mctp1E9PV86 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Mctp1E9PV86 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Mctp1E9PV86 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Mctp1E9PV86 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Mctp1E9PV86 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Mctp1E9PV86 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Mctp1E9PV86 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Mctp1E9PV86 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Mctp1E9PV86 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Mctp1E9PV86 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Mctp1E9PV86 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Mctp1E9PV86 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Mctp1E9PV86 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Mctp1E9PV86 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Mctp1E9PV86 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Mctp1E9PV86 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Mctp1E9PV86 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Mctp1E9PV86 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Mctp1E9PV86 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Mctp1E9PV86 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Mctp1E9PV86 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Mctp1E9PV86 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Mctp1E9PV86 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Mctp1E9PV86 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mctp1E9PV86 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Mctp1E9PV86 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mctp1E9PV86 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mctp1E9PV86 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Mctp1E9PV86 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Mctp1E9PV86 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Mctp1E9PV86 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Mctp1E9PV86 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Mctp1E9PV86 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Mctp1E9PV86 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Mctp1E9PV86 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Mctp1E9PV86 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Mctp1E9PV86 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Mctp1E9PV86 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Mctp1E9PV86 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Mctp1E9PV86 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Mctp1E9PV86 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Mctp1E9PV86 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Mctp1E9PV86 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Mctp1E9PV86 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Mctp1E9PV86 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Mctp1E9PV86 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Mctp1E9PV86 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mctp1E9PV86 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mctp1E9PV86 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Mctp1E9PV86 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mctp1E9PV86 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mctp1E9PV86 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mctp1E9PV86 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Mctp1E9PV86 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Mctp1E9PV86 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms