Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
FliiQ9JJ28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
FliiQ9JJ28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FliiQ9JJ28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
FliiQ9JJ28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
FliiQ9JJ28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
FliiQ9JJ28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FliiQ9JJ28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
FliiQ9JJ28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
FliiQ9JJ28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FliiQ9JJ28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FliiQ9JJ28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FliiQ9JJ28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
FliiQ9JJ28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FliiQ9JJ28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FliiQ9JJ28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
FliiQ9JJ28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
FliiQ9JJ28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FliiQ9JJ28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
FliiQ9JJ28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
FliiQ9JJ28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FliiQ9JJ28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
FliiQ9JJ28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FliiQ9JJ28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
FliiQ9JJ28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FliiQ9JJ28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FliiQ9JJ28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
FliiQ9JJ28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
FliiQ9JJ28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FliiQ9JJ28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
FliiQ9JJ28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FliiQ9JJ28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FliiQ9JJ28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FliiQ9JJ28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FliiQ9JJ28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FliiQ9JJ28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FliiQ9JJ28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
FliiQ9JJ28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FliiQ9JJ28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
FliiQ9JJ28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FliiQ9JJ28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FliiQ9JJ28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FliiQ9JJ28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
FliiQ9JJ28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FliiQ9JJ28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FliiQ9JJ28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FliiQ9JJ28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FliiQ9JJ28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FliiQ9JJ28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FliiQ9JJ28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
FliiQ9JJ28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FliiQ9JJ28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FliiQ9JJ28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FliiQ9JJ28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FliiQ9JJ28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FliiQ9JJ28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FliiQ9JJ28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FliiQ9JJ28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FliiQ9JJ28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FliiQ9JJ28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FliiQ9JJ28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FliiQ9JJ28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FliiQ9JJ28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
FliiQ9JJ28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FliiQ9JJ28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FliiQ9JJ28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FliiQ9JJ28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
FliiQ9JJ28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FliiQ9JJ28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FliiQ9JJ28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FliiQ9JJ28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
FliiQ9JJ28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FliiQ9JJ28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FliiQ9JJ28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
FliiQ9JJ28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FliiQ9JJ28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FliiQ9JJ28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FliiQ9JJ28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FliiQ9JJ28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FliiQ9JJ28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
FliiQ9JJ28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
FliiQ9JJ28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FliiQ9JJ28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FliiQ9JJ28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FliiQ9JJ28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FliiQ9JJ28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FliiQ9JJ28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FliiQ9JJ28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FliiQ9JJ28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FliiQ9JJ28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FliiQ9JJ28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
FliiQ9JJ28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
FliiQ9JJ28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
FliiQ9JJ28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FliiQ9JJ28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FliiQ9JJ28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FliiQ9JJ28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FliiQ9JJ28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FliiQ9JJ28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FliiQ9JJ28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms