RNA–Protein interactions for RNA: YOR057W

SGT1, Transcript of Cochaperone protein, yeast

Gene SGT1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGT1	YOR057W	VTH2	P40890	1549 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	CDC9	P04819	755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	SPC42	P36094	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	CAF16	P43569	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	YBP2	P53169	641 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	IRC10	Q08118	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	BUD3	P25558	1636 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	MYO4	P32492	1471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	PHO8	P11491	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	DSS1	P39112	969 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	HOS4	P40480	1083 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	GSY1	P23337	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	MEF1	P25039	761 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	VBA3	P25594	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	BCD1	P38772	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	PCL5	P38794	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	SDS3	P40505	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	YFL052W	P43551	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	BNA2	P47125	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	GAD1	Q04792	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	CIT2	P08679	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	THI4	P32318	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	ECM1	P39715	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	BAP3	P41815	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	UBC11	P52492	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	NPY1	P53164	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	RIA1	P53893	1110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	ORC4	P54791	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	YML122C	Q03207	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	MSH2	P25847	964 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	FMP52	P40008	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	YTA7	P40340	1379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	SGO1	Q08490	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	SSN2	P38931	1420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	MIH1	P23748	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	PEX6	P33760	1030 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	YHR112C	P38716	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	UGO1	Q03327	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	NHX1	Q04121	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	SRD1	P09007	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	HIR1	P32479	840 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	YKR051W	P36142	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	OSW7	P43611	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	TEL2	P53038	688 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	MTL1	P53214	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
SGT1	YOR057W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	HOG1	P32485	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	HSL7	P38274	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	REV7	P38927	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	SSL2	Q00578	843 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	MLP2	P40457	1679 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	STU1	P38198	1513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	RAD18	P10862	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	LYS9	P38999	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	YKR018C	P36114	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	APT2	P36973	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	FMO1	P38866	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	YAP1802	P53309	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	MCM21	Q06675	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	YOR1	P53049	1477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	SIR3	P06701	978 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	CDC43	P18898	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	KIN3	P22209	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	SFB3	P38810	929 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	NUP60	P39705	539 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	PCL10	P53124	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SGT1	YOR057W	NTG2	Q08214	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18 ms