RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeastyeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIN4YMR138W REC8Q12188 680 aa6.31□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa6.31□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W BI3Q9ZZW7 517 aa6.31□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W VBA3P25594 458 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W SYN8P31377 255 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W FRE1P32791 686 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W BCH2P36122 765 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W VBA5P36172 582 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W TBS1P38114 1094 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W SHE3P38272 425 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W RAD55P38953 406 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W EFM4P40516 257 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W TAF1P46677 1066 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W MND1P53102 219 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W NUT1P53114 1132 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YNL011CP53980 444 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W SLG1P54867 378 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YML083CQ04526 418 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W OPY2Q06810 360 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W TRE1Q08919 783 aa6.3□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W ADE3P07245 946 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W CIT2P08679 460 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W CBF2P32504 956 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W TKL2P33315 681 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W GCS1P35197 352 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W PCH2P38126 564 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W EXO5P38289 585 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W SET5P38890 526 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data6.29□□□□□ -1.4not detected
CIN4YMR138W HOP2P53187 214 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YDR222WQ04925 415 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W SIL1Q08199 421 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W CIR2Q08822 631 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W GPM2Q12008 311 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YOL098CQ12496 1037 aa6.29□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W ERG11P10614 530 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W MTF2P10849 440 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W RAD57P25301 460 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W RAD27P26793 382 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W EFB1P32471 206 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W JNM1P36224 373 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W FHL1P39521 936 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W GEM1P39722 662 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YGR111WP53265 400 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W BTN2P53286 410 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W MUB1Q03162 620 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W SPO71Q03868 1245 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W APC5Q08683 685 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W VPS54Q12071 889 aa6.28□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W YPR117WQ06116 2489 aa6.27□□□□□ -1.4
CIN4YMR138W GFA1P14742 717 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W PUT4P15380 627 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W PGS1P25578 521 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W MNR2P35724 969 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W BLI1P35727 113 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W YKL050CP35736 922 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W YBL036CP38197 257 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W TCD1P38756 429 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W TDA3P38758 523 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W TGL3P40308 642 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W SNZ3P43545 298 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W VPS25P47142 202 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W SNZ2P53824 298 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W YMR018WQ04364 514 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W TAF10Q12030 206 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W MNL2Q12205 849 aa6.27□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W ISF1P32488 338 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W APM2P38700 605 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W RIM4P38741 713 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W YEL075CP39972 122 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W PSY2P40164 858 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W BOP3P53958 396 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W NGL3Q03210 505 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W ARO80Q04052 950 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W SOV1Q04748 898 aa6.26□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W JIP3O13555 125 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W PDR1P12383 1068 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W CKI1P20485 582 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W AEP2P22136 580 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W DSS4P32601 143 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W TSA1P34760 196 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W YKR051WP36142 418 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W SIF2P38262 535 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W RGD1P38339 666 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W RCK2P38623 610 aa6.25□□□□□ -1.41
CIN4YMR138W QNS1P38795 714 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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