RNA–Protein interactions for RNA: YMR007W

YMR007W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR007W, Length 381 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR007WYMR007W GIS3Q12418 502 aa8.74□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W OM45P16547 393 aa8.73□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W SPT23P35210 1082 aa8.73□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W RAD55P38953 406 aa8.73□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W SAH1P39954 449 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W TOS3P43637 560 aa8.73□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W PDC6P26263 563 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W YNL011CP53980 444 aa8.72□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W STE20Q03497 939 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W FLC1Q08967 793 aa8.72□□□□□ -1.01
YMR007WYMR007W IME1P21190 360 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W RNR1P21524 888 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W RRT12P25381 491 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W CBF2P32504 956 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SAC6P32599 642 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W AVT2P39981 480 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W COS5P47187 383 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W CWC24P53769 259 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W TOF2Q02208 771 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W YCG1Q06680 1035 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W YPL216WQ08964 1102 aa8.71□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W COX11P19516 300 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W ATG12P38316 186 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W YBR225WP38321 900 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W DOT6P40059 670 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W DSE1P40077 573 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W NUP42P49686 430 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W NMA2P53204 395 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SEG1Q04279 960 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SLX4Q12098 748 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W STB3Q12427 513 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W LRE1P25579 583 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W DAL1P32375 460 aa8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W CTM1P38818 585 aa8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W RSM25P40496 264 aa8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W GUF1P46943 645 aa8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SAM3Q08986 587 aa8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W NBP2Q12163 236 aa8.69□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SWE1P32944 819 aa8.68□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W XRS2P33301 854 aa8.68□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W NOP4P37838 685 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SBE2P42223 864 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W KEX1P09620 729 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W KIN3P22209 435 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W VBA3P25594 458 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W DSS4P32601 143 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W YKT6P36015 200 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W VBA5P36172 582 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W KTR4P38131 464 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W TIF5P38431 405 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W VTC4P47075 721 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W CPR7P47103 393 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W DAN4P47179 1161 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W HRQ1Q05549 1077 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W APC5Q08683 685 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W CUP1-1P0CX80 61 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W CUP1-2P0CX81 61 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W CDC42P19073 191 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SCJ1P25303 377 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W KIC1P38692 1080 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W FHL1P39521 936 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W FIG4P42837 879 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W YNR065CP53751 1116 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W RGR1P19263 1082 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W FPR1P20081 114 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W STE5P32917 917 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W HSP78P33416 811 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W GIP1P38229 639 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W PPX1P38698 397 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W OSW5P40219 148 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W RMD8P43620 662 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W COG4Q06096 861 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W DDC1Q08949 612 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W PIN2Q12057 282 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YMR007WYMR007W REV1P12689 985 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W SAT4P25333 603 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W GUT1P32190 709 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W TCD2P36101 447 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W FAA3P39002 694 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W CDC1P40986 491 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W ECM3Q99252 613 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W SGE1P33335 543 aa8.63□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W GDH3P39708 457 aa8.63□□□□□ -1.03
YMR007WYMR007W GIP4P39732 760 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 164.3 ms