RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	YKR075C	P36155	307 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	AXL1	P40851	1208 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	VPS9	P54787	451 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	NSI1	Q12457	570 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBP12	YJL197W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BRF1	P29056	596 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BCK2	P33306	851 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	UME6	P39001	836 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PIK1	P39104	1066 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YEL068C	P39977	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	JEM1	P40358	645 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	VID28	P40547	921 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YJL045W	P47052	634 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	TRI1	Q05024	226 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	COQ4	O13525	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PDX1	P16451	410 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YCL002C	P25565	263 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	EAF5	P39995	279 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CBK1	P53894	756 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ADH4	P10127	382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CDC26	P14724	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RPC53	P25441	422 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YSC84	P32793	468 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SIR1	P21691	654 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	HXT4	P32467	576 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CYB2	P00175	591 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	DGR2	P32330	852 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SAP190	P36123	1033 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CIR1	P42940	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	HDA1	P53973	706 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ADP1	P25371	1049 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	FLR1	P38124	548 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	OSH7	P38755	437 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	DUN1	P39009	513 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PSF2	P40359	213 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
UBP12	YJL197W	RMD8	P43620	662 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	GPI8	P49018	411 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	LYS5	P50113	272 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	BTN2	P53286	410 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	TIM10	P87108	93 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ADY3	Q07732	790 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PSR1	Q07800	427 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	DBF4	P32325	704 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PRM2	P40534	656 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	IMA5	P40884	581 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NNF2	P53253	936 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	SFB2	P53953	876 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CRR1	Q05790	422 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RED1	P14291	827 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CKA1	P15790	372 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ERS1	P17261	260 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ACE2	P21192	770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	CLB4	P24871	460 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	KHA1	P40309	873 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	TRM8	Q12009	286 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	PRC1	P00729	532 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	STE13	P33894	931 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YBR225W	P38321	900 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YEL076C	P39971	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	IMA1	P53051	589 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	GIS4	Q04233	774 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBP12	YJL197W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 85.2 ms