RNA–Protein interactions for RNA: YHR116W

COX23, Transcript of Protein that functions in mitochondrial copper homeostasis, yeast

Gene COX23, Length 456 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX23	YHR116W	ALR2	P43553	858 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	CIT3	P43635	486 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	VTC4	P47075	721 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	JJJ3	P47138	172 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	ERP6	P53198	216 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	CUZ1	P53899	274 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SPO20	Q04359	397 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	AIM33	Q04516	312 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SMC5	Q08204	1093 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	HFI1	Q12060	488 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	TIP41	Q12199	356 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	HIF1	Q12373	385 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	TMA17	Q12513	150 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	CDC6	P09119	513 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	TOP3	P13099	656 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	GSY1	P23337	708 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	DID4	P36108	232 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	EXO5	P38289	585 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	FIS1	P40515	155 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	HUL4	P40985	892 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	LYS5	P50113	272 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	GPG1	P53130	126 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	RTC4	P53850	401 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	MUK1	Q02866	612 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	UGO1	Q03327	502 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	MMR1	Q06324	491 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YOR378W	Q08902	515 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YPL066W	Q12194	479 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SMC6	Q12749	1114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SRD1	P09007	221 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	TAF13	P11747	167 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	ALG1	P16661	449 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	MEF1	P25039	761 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SYN8	P31377	255 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SFP1	P32432	683 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	ATG19	P35193	415 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	DRE2	P36152	348 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	MRPL16	P38064	232 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SLX1	P38324	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	BUD16	P39988	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	EAF5	P39995	279 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SLS1	P42900	643 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YGL176C	P46945	554 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	HLJ1	P48353	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	CTF18	P49956	741 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	MET13	P53128	600 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	DIP5	P53388	608 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
COX23	YHR116W	HEH2	Q03281	663 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	FUS2	Q05670	677 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	COQ9	Q05779	260 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YLR001C	Q07895	862 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	ELG1	Q12050	791 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	DCS2	Q12123	353 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YPR117W	Q06116	2489 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	WHI2	P12611	486 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	CKA2	P19454	339 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	TFA2	P36145	328 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	MRPL7	P36519	292 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	APN2	P38207	520 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YHR131C	P38835	850 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YAP1801	P38856	637 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	FMP10	P40098	244 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	OPT1	P40897	799 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	GCV2	P49095	1034 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YGR237C	P50089	785 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	ALT2	P52892	507 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YNR014W	P53719	212 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COX23	YHR116W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.4 ms